194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2986 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  83.72 
 
 		 220 aa  362  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.98 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  43.96 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  43.15 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.54 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  40.45 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  39.23 
 
 		 238 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  39.89 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  36.68 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.33 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.45 
 
 		 243 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.33 
 
 		 232 aa  118  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.82 
 
 		 243 aa  117  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.22 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.76 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.96 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  34.69 
 
 		 233 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.07 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  34.97 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.52 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  35.96 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.89 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  34.43 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.89 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  33 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  34.43 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.39 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.89 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.27 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  34.97 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.1 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  34.72 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  36.56 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.56 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.2 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  34.83 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  36.52 
 
 		 250 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.8 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  34.95 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.17 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.2 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  30.05 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.83 
 
 		 240 aa  101  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.11 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.97 
 
 		 252 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  31.9 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  35.52 
 
 		 322 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.33 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  31.72 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.63 
 
 		 267 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  33.88 
 
 		 334 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  33.85 
 
 		 243 aa  88.6  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  31.69 
 
 		 263 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.69 
 
 		 263 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  30.1 
 
 		 267 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  31.15 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.69 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  31.15 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.15 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  31.15 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.9 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.05 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.15 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.15 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  27.72 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  32.99 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  32.8 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.17 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  27.75 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0942  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000977643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  27 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  24.74 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  34.94 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  26.87 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  23.53 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.12 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  31.69 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  22.17 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  25.99 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  24.24 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  35.85 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  28.78 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.77 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.56 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  28.11 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  29.36 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  28.04 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  27.86 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>