More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2982 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  86.29 
 
 		 197 aa  353  8.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  58.76 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  49.43 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  44.39 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  46.15 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  43.43 
 
 		 207 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  44.24 
 
 		 195 aa  160  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  41.49 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  37.88 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  40.2 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  44.83 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  41.5 
 
 		 204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  37.69 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  41.05 
 
 		 191 aa  147  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  47.4 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  38.95 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  42.51 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  41.34 
 
 		 209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  42.07 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  45.24 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  42.16 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  41.51 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  46.5 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  40.83 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  46.5 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  38.86 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  42.7 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  41.04 
 
 		 211 aa  138  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  38.6 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  37.82 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  39.8 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 		 205 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  45.51 
 
 		 200 aa  134  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  37.95 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  37.95 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  37.95 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  37.95 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  37.95 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  37.76 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  42.44 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  38.78 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  38.78 
 
 		 205 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  38.78 
 
 		 205 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  38.58 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  42 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  44.3 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  38.46 
 
 		 181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  44.94 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  38.46 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  38.46 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  41.14 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  38.33 
 
 		 264 aa  124  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  34.76 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  39.74 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  34.02 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 221 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  39.26 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  38.46 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 217 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 217 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  38.15 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  37.57 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  37.85 
 
 		 275 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  40.4 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  38.15 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  38.15 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  38.96 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  38.15 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  40.38 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  34.12 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  38.61 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  35.85 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  30.85 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  40.31 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  35.88 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 		 223 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  37.18 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 		 223 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  38.78 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  39.29 
 
 		 220 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  35.08 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  41.14 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  39.01 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  32.7 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  36.47 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>