97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2935 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2935  peptidase S41  100 
 
 
691 aa  1385    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000791887  normal  0.0220512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3207  peptidase S41  84.87 
 
 
692 aa  1141    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000881492  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2210  peptidase S41  29.29 
 
 
558 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185176  normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3865  peptidase S41  25 
 
 
763 aa  99.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0264679  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  28.17 
 
 
482 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  28.71 
 
 
389 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  26.51 
 
 
465 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  27.96 
 
 
483 aa  73.9  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  22.12 
 
 
425 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2226  peptidase S41  22.35 
 
 
455 aa  61.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  24.23 
 
 
418 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  25.22 
 
 
416 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  28.09 
 
 
335 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  24.69 
 
 
1193 aa  56.2  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.44 
 
 
379 aa  55.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  25.48 
 
 
446 aa  54.7  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  22.22 
 
 
1079 aa  54.7  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  25.31 
 
 
427 aa  54.7  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  24.93 
 
 
489 aa  53.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.49 
 
 
1090 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25.09 
 
 
457 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  23.08 
 
 
463 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  23.53 
 
 
410 aa  53.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  25 
 
 
451 aa  52.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  24 
 
 
444 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  24.36 
 
 
444 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  25.53 
 
 
470 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  24.12 
 
 
428 aa  52  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  29.76 
 
 
300 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  25.65 
 
 
432 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  24.36 
 
 
444 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  23.6 
 
 
439 aa  50.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0259  peptidase S41  28.76 
 
 
484 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.807068  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0676  peptidase S41  25.93 
 
 
405 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  21.74 
 
 
469 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  23.53 
 
 
447 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  23.9 
 
 
434 aa  48.9  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  21.66 
 
 
478 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  25.08 
 
 
439 aa  48.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  21.74 
 
 
469 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  24.12 
 
 
437 aa  48.1  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  21.74 
 
 
469 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  27.84 
 
 
429 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  23.72 
 
 
431 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  21.74 
 
 
478 aa  47.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  21.74 
 
 
478 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  24 
 
 
434 aa  48.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  21.74 
 
 
478 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  21.15 
 
 
478 aa  48.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 
426 aa  47.8  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  21.74 
 
 
478 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  22.27 
 
 
427 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.49 
 
 
1067 aa  47.4  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  24.92 
 
 
438 aa  47.4  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1647  peptidase S41  25.87 
 
 
596 aa  47.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.754893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  22.44 
 
 
457 aa  47  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  22.45 
 
 
443 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1002  peptidase S41  28.42 
 
 
535 aa  47.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  24.04 
 
 
444 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  25.31 
 
 
538 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  21.61 
 
 
478 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  25 
 
 
439 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6647  peptidase S41  27.71 
 
 
488 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  23.88 
 
 
397 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  23.74 
 
 
458 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  23.74 
 
 
458 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  24.84 
 
 
472 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  26.45 
 
 
417 aa  46.6  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2828  peptidase S41  25 
 
 
434 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.282259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  24.63 
 
 
1082 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  25.83 
 
 
1092 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  25.18 
 
 
1094 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  23.9 
 
 
402 aa  45.8  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  24.3 
 
 
412 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  23.9 
 
 
402 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1722  carboxy-terminal protease  23.19 
 
 
683 aa  45.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000352033  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  23.38 
 
 
401 aa  45.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  22.98 
 
 
423 aa  45.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  25.41 
 
 
1094 aa  44.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  21.72 
 
 
428 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  24.52 
 
 
444 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  24.01 
 
 
428 aa  44.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1658  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  25.81 
 
 
719 aa  44.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  21.98 
 
 
1089 aa  44.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  22.74 
 
 
428 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  23.11 
 
 
475 aa  44.7  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  24.94 
 
 
1094 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  23.59 
 
 
440 aa  44.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  24.04 
 
 
427 aa  44.3  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  22.07 
 
 
472 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  25.12 
 
 
1094 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  22.87 
 
 
432 aa  44.3  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  24.76 
 
 
468 aa  44.3  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  25.12 
 
 
1094 aa  44.3  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2017  hypothetical protein  21.18 
 
 
427 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  25.79 
 
 
377 aa  43.9  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  24.06 
 
 
428 aa  43.9  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>