73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2909 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  603  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  78.47 
 
 
319 aa  403  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  79.05 
 
 
340 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  81.62 
 
 
350 aa  361  8e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  81.61 
 
 
290 aa  361  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  79.1 
 
 
376 aa  360  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  80.36 
 
 
339 aa  353  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  81.74 
 
 
312 aa  341  8e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  78.6 
 
 
314 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  76.02 
 
 
289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  75.31 
 
 
314 aa  332  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  81 
 
 
343 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  74.07 
 
 
345 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  81.4 
 
 
402 aa  325  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  74.46 
 
 
321 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  53.78 
 
 
333 aa  246  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  49.24 
 
 
332 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  51.87 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  48.46 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  51.85 
 
 
302 aa  212  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  49.8 
 
 
319 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  49.59 
 
 
330 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  53.06 
 
 
160 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  44.17 
 
 
249 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  35.56 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  31.62 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  33.89 
 
 
244 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  26.28 
 
 
259 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  27.82 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  26.42 
 
 
243 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  31.33 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  31.65 
 
 
230 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 
238 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  24.74 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  30.43 
 
 
274 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  27.34 
 
 
256 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  37.91 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  30.66 
 
 
225 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  40.66 
 
 
108 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  27.62 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  27.64 
 
 
245 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  25.1 
 
 
254 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  27.1 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  23.58 
 
 
229 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  30.94 
 
 
237 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  30.09 
 
 
281 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  27.6 
 
 
222 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  26.19 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  29.75 
 
 
195 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  29.05 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  25.37 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  29.86 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1492  hypothetical protein  30.61 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  25.37 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  25.93 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  27 
 
 
217 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  28.87 
 
 
200 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  38.37 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  24.3 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  26.42 
 
 
204 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  37.78 
 
 
235 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  37.78 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  27.62 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  33.87 
 
 
244 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  33.96 
 
 
188 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 
235 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  25.48 
 
 
256 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  36.92 
 
 
254 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  26.95 
 
 
229 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  38.81 
 
 
186 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  26.42 
 
 
204 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>