229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2856 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  100 
 
 
374 aa  715    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1573  major facilitator superfamily MFS_1  45.35 
 
 
410 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0878  major facilitator transporter  41.92 
 
 
401 aa  222  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2631  twin-arginine translocation pathway signal  36.59 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.774949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  33.73 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  29.49 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.37 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  31.67 
 
 
393 aa  97.1  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  29.94 
 
 
399 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  27.56 
 
 
432 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  29.94 
 
 
399 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  29.94 
 
 
399 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.4 
 
 
405 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  32.98 
 
 
414 aa  93.2  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.12 
 
 
396 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
387 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  30.49 
 
 
400 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  27.72 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  29.66 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  30.65 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 
433 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
407 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  29.31 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  31.47 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  29.38 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  30.55 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  26.53 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
435 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
394 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  26.88 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  29.52 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  28.51 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  34.6 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  33.33 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  27.57 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  28.61 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  26.89 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  30.35 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  28.15 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  30.4 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  28.57 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  28.57 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  30.38 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  30.38 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  30.38 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  30.06 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  30.38 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  30.38 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  30.06 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  30.06 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  29.23 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  28.78 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  30.39 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  26.62 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  32.41 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  28.81 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  29.01 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  29.02 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  28.04 
 
 
383 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
389 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  28.26 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  29.15 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  28.26 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  25.94 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  28.26 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  29.58 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 
408 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
430 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
389 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
386 aa  67  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  27.99 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  27.99 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  27.64 
 
 
378 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  27.64 
 
 
378 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  27.64 
 
 
378 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  27.64 
 
 
378 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  27.64 
 
 
378 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  26.07 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>