148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2808 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  66.26 
 
 
894 aa  926    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  100 
 
 
894 aa  1728    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  43.28 
 
 
1424 aa  307  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  41.82 
 
 
1428 aa  304  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  37.4 
 
 
1057 aa  208  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  37.3 
 
 
1053 aa  203  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  33.65 
 
 
1034 aa  181  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  30.02 
 
 
1157 aa  175  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  30.47 
 
 
1073 aa  164  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  34.67 
 
 
618 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  30.34 
 
 
1167 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  32.49 
 
 
617 aa  94  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.32 
 
 
2194 aa  89  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.25 
 
 
1118 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.62 
 
 
1113 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.51 
 
 
1225 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.64 
 
 
1340 aa  84.7  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.11 
 
 
1012 aa  84.3  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.58 
 
 
1222 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.83 
 
 
768 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.51 
 
 
889 aa  80.9  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  32.86 
 
 
1037 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  41.67 
 
 
2305 aa  75.1  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.56 
 
 
928 aa  74.7  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  41.51 
 
 
2310 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.64 
 
 
1269 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.64 
 
 
891 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.64 
 
 
1269 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  28 
 
 
738 aa  71.2  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2254  hypothetical protein  28.96 
 
 
443 aa  70.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136366  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  57.14 
 
 
830 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.58 
 
 
1009 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4382  Ricin B lectin  29.03 
 
 
490 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.488443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
354 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.17 
 
 
1004 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.58 
 
 
1180 aa  62  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4381  Ricin B lectin  27.83 
 
 
476 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  38.3 
 
 
346 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3938  FHA domain-containing protein  36.17 
 
 
529 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2929  hypothetical protein  26.59 
 
 
447 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  53.85 
 
 
433 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3061  FHA domain-containing protein  44.44 
 
 
159 aa  58.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  34.58 
 
 
16311 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0082  FHA domain containing protein  44 
 
 
156 aa  55.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.25 
 
 
615 aa  55.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  43.1 
 
 
518 aa  55.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.26 
 
 
1800 aa  54.7  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  24.49 
 
 
804 aa  54.3  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  30.33 
 
 
162 aa  54.3  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1396  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  45.21 
 
 
441 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6306  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
307 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3610  FHA domain-containing protein  39.73 
 
 
1083 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133467  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  33.1 
 
 
453 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3468  FHA domain containing protein  40.51 
 
 
544 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.371082  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5377  hypothetical protein  27.19 
 
 
446 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.1 
 
 
1415 aa  52.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0025  FHA domain containing protein  40 
 
 
160 aa  52.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3334  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40 
 
 
554 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  54.32 
 
 
846 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  41.82 
 
 
513 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.63 
 
 
1661 aa  52.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3423  protein kinase  44.83 
 
 
402 aa  52  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410909  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  49.07 
 
 
1394 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1295  FHA domain containing protein  36.19 
 
 
295 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  46.81 
 
 
242 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  26.27 
 
 
845 aa  51.6  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1396  FHA domain containing protein  36.19 
 
 
295 aa  51.2  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  35.06 
 
 
932 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  35.06 
 
 
750 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.35 
 
 
510 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  44.68 
 
 
241 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.99 
 
 
3396 aa  50.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3801  fibronectin type III domain-containing protein  27.49 
 
 
484 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00993794  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.71 
 
 
547 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5251  FHA domain containing protein  40.74 
 
 
168 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.462718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3436  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
244 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4616  FHA domain containing protein  31.91 
 
 
328 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  51.9 
 
 
356 aa  49.7  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3479  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39 
 
 
554 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  36.51 
 
 
238 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  41.82 
 
 
916 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0040  FHA domain containing protein  43.84 
 
 
154 aa  49.7  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0027  forkhead-associated protein  39.76 
 
 
158 aa  49.3  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00230  FHA domain-containing protein  39.74 
 
 
160 aa  49.3  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.853372  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.91 
 
 
1091 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3415  putative sigma54 specific transcriptional regulator  39 
 
 
554 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0025  FHA domain-containing protein  38.67 
 
 
160 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18260  FHA domain-containing protein  32.98 
 
 
167 aa  48.9  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.56 
 
 
1029 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2147  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1341  FHA domain containing protein  39.44 
 
 
374 aa  48.9  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2551  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
418 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  32.56 
 
 
1029 aa  48.5  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0076  FHA domain containing protein  45.33 
 
 
166 aa  48.5  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6477  FHA domain-containing protein  41.07 
 
 
246 aa  48.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0374778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1298  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
388 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  29.63 
 
 
2796 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.71 
 
 
647 aa  48.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  33.71 
 
 
8871 aa  48.1  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1399  FHA domain containing protein  40 
 
 
380 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00835094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>