154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2807 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  74.25 
 
 
1428 aa  1987    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  100 
 
 
1424 aa  2794    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  38.97 
 
 
894 aa  295  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  42.79 
 
 
894 aa  294  8e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  32.74 
 
 
1057 aa  167  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  33.43 
 
 
618 aa  164  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  40.42 
 
 
1762 aa  164  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  35.74 
 
 
617 aa  161  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  33.43 
 
 
1053 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  32.03 
 
 
1061 aa  159  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  30.77 
 
 
1073 aa  154  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  28.48 
 
 
1157 aa  142  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  28.05 
 
 
1034 aa  139  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0957  OmpA/MotB domain protein  48.06 
 
 
716 aa  126  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0225193  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  34.91 
 
 
3227 aa  123  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  42.14 
 
 
913 aa  114  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  40.19 
 
 
852 aa  105  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.94 
 
 
3824 aa  97.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  28.1 
 
 
3824 aa  97.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  53.66 
 
 
978 aa  96.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  29.01 
 
 
5743 aa  95.5  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.57 
 
 
3721 aa  94.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.75 
 
 
3824 aa  94.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  29.37 
 
 
3325 aa  94  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  47.37 
 
 
1167 aa  88.2  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  41.73 
 
 
373 aa  87.8  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  27.31 
 
 
1902 aa  86.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  26.84 
 
 
3739 aa  85.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  26.61 
 
 
653 aa  81.6  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.21 
 
 
1332 aa  80.9  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  28.39 
 
 
675 aa  79  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.66 
 
 
1212 aa  77.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  33.33 
 
 
2503 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  40.56 
 
 
3699 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  27.88 
 
 
1219 aa  77.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.56 
 
 
3699 aa  75.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  34.22 
 
 
3544 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  32.99 
 
 
3562 aa  73.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.21 
 
 
1001 aa  73.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  26.25 
 
 
3586 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.18 
 
 
3552 aa  72  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  32.05 
 
 
2522 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.35 
 
 
1109 aa  70.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  28.9 
 
 
1096 aa  68.6  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  26.32 
 
 
1825 aa  68.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  39.25 
 
 
1193 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  27.91 
 
 
1951 aa  67  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  38.08 
 
 
2927 aa  67.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  45.79 
 
 
2802 aa  66.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  28.33 
 
 
3736 aa  66.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  37.5 
 
 
1736 aa  66.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2584  hypothetical protein  44.44 
 
 
793 aa  65.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161987  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  38.18 
 
 
3089 aa  65.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  21.36 
 
 
2552 aa  65.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  41.57 
 
 
346 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  35 
 
 
607 aa  63.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  35.58 
 
 
616 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  43.75 
 
 
354 aa  64.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  28.75 
 
 
3734 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  36.9 
 
 
518 aa  63.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  28.12 
 
 
916 aa  62.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  28.89 
 
 
2715 aa  63.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0600  hypothetical protein  27.56 
 
 
531 aa  62.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  23.9 
 
 
1695 aa  62.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  28.84 
 
 
4430 aa  62  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.37 
 
 
6885 aa  60.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  25.24 
 
 
744 aa  60.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  34.32 
 
 
2207 aa  60.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  29.6 
 
 
1141 aa  58.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.36 
 
 
1004 aa  58.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  32.37 
 
 
513 aa  58.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  28.27 
 
 
2704 aa  57.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  34.29 
 
 
1303 aa  56.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3610  FHA domain-containing protein  39.02 
 
 
1083 aa  56.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133467  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  31.05 
 
 
739 aa  55.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  26.76 
 
 
4697 aa  55.5  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  38.1 
 
 
756 aa  55.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  35.19 
 
 
586 aa  55.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.73 
 
 
4106 aa  55.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  31.78 
 
 
812 aa  55.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4660  hypothetical protein  27.8 
 
 
400 aa  54.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  45.16 
 
 
560 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2147  FHA domain-containing protein  34.17 
 
 
137 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  30.97 
 
 
562 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  26.01 
 
 
2117 aa  54.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  25.42 
 
 
1278 aa  53.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  25.25 
 
 
1224 aa  53.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.68 
 
 
1919 aa  54.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  39.8 
 
 
897 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3938  FHA domain-containing protein  32.93 
 
 
529 aa  53.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  33.94 
 
 
663 aa  53.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  31.25 
 
 
1047 aa  52.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  36.47 
 
 
863 aa  52.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  36.08 
 
 
828 aa  52.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  32.72 
 
 
1029 aa  52  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  32.14 
 
 
599 aa  52.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0941  hypothetical protein  30 
 
 
791 aa  52  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.10709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.37 
 
 
726 aa  52  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  25.73 
 
 
2839 aa  51.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  27.24 
 
 
499 aa  51.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>