More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2789 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 323 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  40.37 
 
 		 433 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  61.69 
 
 		 653 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  58.02 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  55.13 
 
 		 653 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  58.24 
 
 		 653 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  58.9 
 
 		 562 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  57.65 
 
 		 655 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  38.99 
 
 		 549 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  36.79 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  41.98 
 
 		 509 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  41.29 
 
 		 428 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  54.97 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  39.31 
 
 		 430 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  41.42 
 
 		 424 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  56.02 
 
 		 429 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  49.13 
 
 		 538 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  51.3 
 
 		 667 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  35.69 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  52.11 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  48.91 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  32.01 
 
 		 694 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  53.97 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  44.65 
 
 		 638 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  46.48 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  51.41 
 
 		 421 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  50.32 
 
 		 376 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  50.39 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  48.61 
 
 		 510 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  50.39 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  48.85 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  46.88 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  47.89 
 
 		 357 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  36.07 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  46.38 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  41.73 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  42.6 
 
 		 445 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  47.06 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  48.3 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  32.84 
 
 		 286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  47.69 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  45.65 
 
 		 362 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  47.11 
 
 		 271 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  50.42 
 
 		 370 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  42.64 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  45.39 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  37.85 
 
 		 568 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  29.5 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  38.04 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  47.46 
 
 		 231 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.84 
 
 		 284 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  42.31 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  43.31 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  41.09 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  45.52 
 
 		 559 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  43.75 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  44.7 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  41.54 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  41.09 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  35.8 
 
 		 689 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  46.61 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  44.12 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  36.31 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  34.81 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  44.63 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  42.52 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  41.01 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  42.31 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  40.16 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  43.57 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  41.54 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  39.87 
 
 		 521 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  38.04 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  45.3 
 
 		 549 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  30.45 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 556 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  41.88 
 
 		 294 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  38.35 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  36.92 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  40.83 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  39.35 
 
 		 506 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  41.98 
 
 		 523 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  43.48 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  49.04 
 
 		 359 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  30.94 
 
 		 484 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  39.34 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  37.98 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  40.83 
 
 		 361 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  38.28 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  38.52 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  42.11 
 
 		 580 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1098  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 514 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  36.77 
 
 		 511 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  39.73 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  35.22 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>