71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2723 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  84 
 
 		 550 aa  946    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1103    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  55.81 
 
 		 1025 aa  560  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  44.01 
 
 		 544 aa  409  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  31.95 
 
 		 392 aa  144  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  30.79 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  26.72 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  28.5 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  28.57 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  26.89 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  27.11 
 
 		 369 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  27.27 
 
 		 601 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  25.41 
 
 		 586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  27.27 
 
 		 601 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  26.92 
 
 		 596 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  25.8 
 
 		 600 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  26.16 
 
 		 597 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  27.17 
 
 		 446 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  26.09 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  26.68 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  26.63 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  25.99 
 
 		 461 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  25.41 
 
 		 425 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  25.46 
 
 		 450 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25.48 
 
 		 340 aa  93.2  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  25.74 
 
 		 1276 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  25.3 
 
 		 662 aa  81.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  26.25 
 
 		 803 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  23.34 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  25.89 
 
 		 801 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  22.88 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  24.09 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  23.76 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  24.09 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  24.09 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  23.03 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  23.43 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  21.75 
 
 		 891 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  23.76 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  23.76 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  23.43 
 
 		 584 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  21.83 
 
 		 1141 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  25.15 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  22.41 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 		 685 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.86 
 
 		 684 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  26.9 
 
 		 605 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 672 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  26.75 
 
 		 602 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 672 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  25.59 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  21.68 
 
 		 326 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  24.6 
 
 		 442 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  24.6 
 
 		 442 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  24.6 
 
 		 442 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  24.6 
 
 		 442 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  24.6 
 
 		 442 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  24.6 
 
 		 442 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  24.6 
 
 		 442 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 		 669 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 680 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  28.68 
 
 		 564 aa  47.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  23.57 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  25.44 
 
 		 604 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  26.21 
 
 		 614 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  24.51 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  24.51 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  24.51 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  41.07 
 
 		 307 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  25.41 
 
 		 442 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>