29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2716 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  662    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  61.8 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  27.19 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  29.34 
 
 		 326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.48 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  29.52 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  25.08 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  23.51 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  24 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.22 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24.36 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.32 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  22.71 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  21.55 
 
 		 745 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  22.22 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3801  hypothetical protein  25.28 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  23 
 
 		 769 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  25 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  25.9 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.6 
 
 		 751 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2620  hypothetical protein  28.79 
 
 		 448 aa  52.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0236435  hitchhiker  0.00226971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  25.82 
 
 		 751 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  26.32 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  22.95 
 
 		 750 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.9 
 
 		 756 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.56 
 
 		 755 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  23.2 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  22.33 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>