11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2681 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2681  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  246  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00455306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3018  hypothetical protein  78.26 
 
 		 125 aa  167  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0293941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0693  hypothetical protein  54.4 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1825  hypothetical protein  53.17 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1940  hypothetical protein  45.24 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194852 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2531  hypothetical protein  44.44 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.660934  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2335  hypothetical protein  36.43 
 
 		 191 aa  84.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2457  hypothetical protein  31.5 
 
 		 190 aa  77.4  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0663583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4294  putative transcriptional regulator  29.92 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2052  hypothetical protein  29.93 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.31699  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1824  putative transcriptional regulator  37.01 
 
 		 304 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>