66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2679 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  79.86 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  51.43 
 
 		 209 aa  128  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 		 363 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  41.48 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  41.26 
 
 		 452 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.42 
 
 		 382 aa  77.4  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  41.22 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  38.97 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.46 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  40.82 
 
 		 370 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 		 391 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  38.46 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.46 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  40.46 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.46 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.46 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  40.77 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  37.69 
 
 		 253 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.93 
 
 		 356 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  37.69 
 
 		 253 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  36.17 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.6 
 
 		 378 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  36.92 
 
 		 254 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.8 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  40.31 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.51 
 
 		 364 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  37.9 
 
 		 412 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.62 
 
 		 427 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  34.62 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  34.48 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  39.85 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  34.09 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  35.04 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  32.8 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  38.06 
 
 		 412 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  31.45 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  30.97 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  35.71 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  30.83 
 
 		 211 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  36.78 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 402 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  27.07 
 
 		 194 aa  50.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  33.07 
 
 		 216 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  32.03 
 
 		 198 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  32 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  34.44 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  32.18 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  33.1 
 
 		 199 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  28.81 
 
 		 376 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  28.24 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  27.91 
 
 		 313 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  28.03 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  28.24 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0205  ribonuclease H  26.51 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  28.24 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  28.24 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  28.24 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  28.24 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  28.24 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  28.24 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  28.24 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  37.7 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  32.03 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  27.27 
 
 		 132 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  32.33 
 
 		 145 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>