168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2676 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 332 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  85.54 
 
 		 332 aa  561  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.59 
 
 		 333 aa  289  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  37.83 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.54 
 
 		 334 aa  185  7e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.53 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  34.23 
 
 		 545 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  37.12 
 
 		 553 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.73 
 
 		 339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  33.64 
 
 		 598 aa  172  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.38 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  34.59 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  32.93 
 
 		 326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.93 
 
 		 544 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  35.28 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  30.48 
 
 		 731 aa  160  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.12 
 
 		 731 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  34.51 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  33.44 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  34.51 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  30.12 
 
 		 727 aa  156  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  31.86 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  35.91 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  36.26 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  34.1 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.36 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.84 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.79 
 
 		 550 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.75 
 
 		 570 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.18 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  36.84 
 
 		 525 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  32.27 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  33.91 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  35.14 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.82 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  31.82 
 
 		 594 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  31.88 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  28.75 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.04 
 
 		 580 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  31.87 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  31.78 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.92 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.7 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.94 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  34.5 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.82 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  31.58 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.18 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  29.82 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.27 
 
 		 559 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  31.01 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.67 
 
 		 342 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  34.35 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  32.35 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.36 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.12 
 
 		 344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.84 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.44 
 
 		 342 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  30.86 
 
 		 344 aa  126  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  33.86 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  27.93 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.2 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  30.89 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  32.89 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.6 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  33.87 
 
 		 691 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  29.33 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  32.66 
 
 		 558 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.83 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  33.14 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  27.55 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.24 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.53 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.83 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.3 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.93 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  29.97 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  31.11 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.9 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.95 
 
 		 326 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  28.15 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  28.82 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  25.84 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.98 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.66 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  26.89 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.31 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  24.7 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  27.61 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  33.16 
 
 		 207 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  26.59 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  24.3 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.67 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  26.84 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  25.52 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.12 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  25.33 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  25.83 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>