More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2599 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.82 
 
 		 225 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  58.82 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.25 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 222 aa  241  6e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  54.3 
 
 		 223 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  55.8 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.56 
 
 		 224 aa  238  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 		 224 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  54.3 
 
 		 223 aa  238  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.56 
 
 		 224 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  52.89 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.19 
 
 		 227 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  52 
 
 		 224 aa  234  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 224 aa  234  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  52 
 
 		 224 aa  234  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  53.12 
 
 		 224 aa  234  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 224 aa  234  9e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  55.66 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  54.75 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  53.85 
 
 		 228 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 236 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  53.39 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00315  probable two component response regulator transcription regulator protein  50.88 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  52.94 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  54.42 
 
 		 283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.39 
 
 		 226 aa  224  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  52.49 
 
 		 228 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  52.49 
 
 		 228 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.49 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.13 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.79 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  53.15 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.44 
 
 		 238 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 		 228 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  52.94 
 
 		 228 aa  221  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.94 
 
 		 225 aa  221  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 		 223 aa  221  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  53.18 
 
 		 219 aa  221  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.7 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  51.8 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.94 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.68 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.05 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.68 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.68 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.68 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  46.15 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.49 
 
 		 225 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.49 
 
 		 225 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.49 
 
 		 225 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  47.49 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  47.79 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.04 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.13 
 
 		 225 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  51.8 
 
 		 225 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6519  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.68 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  51.34 
 
 		 228 aa  214  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 228 aa  214  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 		 225 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 228 aa  214  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.04 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.68 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.58 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 226 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  51.58 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  51.14 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  49.56 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.79 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.56 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.87 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  50.23 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.04 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  49.78 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  52.25 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 230 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.88 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  49.78 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 231 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.04 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>