More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2515 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 372 aa  733    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  94.89 
 
 		 372 aa  699    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  69.02 
 
 		 369 aa  518  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  61.98 
 
 		 368 aa  448  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  59.45 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  56.52 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  56.56 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  55.74 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  51.65 
 
 		 363 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  50.81 
 
 		 373 aa  349  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  51.51 
 
 		 359 aa  345  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  51.92 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  51.23 
 
 		 363 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  50.14 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  49.59 
 
 		 364 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  50.14 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  47.81 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  51.79 
 
 		 363 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  49.18 
 
 		 358 aa  332  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  53.66 
 
 		 356 aa  332  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  50.96 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  52.72 
 
 		 341 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  45.9 
 
 		 366 aa  316  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  48.02 
 
 		 348 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  45.9 
 
 		 365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  52.59 
 
 		 341 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  52 
 
 		 342 aa  311  7.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  51.71 
 
 		 342 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  51 
 
 		 341 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  47.53 
 
 		 359 aa  305  8.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  48.11 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  42.51 
 
 		 368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  49.71 
 
 		 341 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  50.29 
 
 		 340 aa  300  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  49 
 
 		 344 aa  300  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  46.17 
 
 		 367 aa  299  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  49.43 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  50.71 
 
 		 342 aa  296  6e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  44.24 
 
 		 372 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  50.29 
 
 		 342 aa  292  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  48.56 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  48.11 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  51.15 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  49.57 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  45.5 
 
 		 360 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  47.56 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  47.43 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  45.85 
 
 		 349 aa  282  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  46.15 
 
 		 341 aa  282  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  46.22 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  46.22 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  47.14 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  46 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  45.43 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  46.86 
 
 		 343 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  46.86 
 
 		 343 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  46.86 
 
 		 343 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  47.16 
 
 		 346 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  46.31 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  48.13 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  44.6 
 
 		 343 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  47.71 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  42.16 
 
 		 365 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  41.3 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  41.3 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  47.41 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  45.3 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  46.72 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  44.02 
 
 		 366 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  44.86 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  44.22 
 
 		 351 aa  255  7e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  44.19 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  41.88 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  41.1 
 
 		 362 aa  252  8.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  42.98 
 
 		 342 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  44.22 
 
 		 339 aa  246  6e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  42.74 
 
 		 344 aa  246  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  42.52 
 
 		 355 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  39.46 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  39.85 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  40.4 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  38.01 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  43.27 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  39.89 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  38.72 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  38 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  40.87 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  36.23 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  38.44 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  37.33 
 
 		 319 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  37.98 
 
 		 319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  37.98 
 
 		 319 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  37.64 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  37.25 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  37.25 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  37.25 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  37.25 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  37.25 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>