46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2514 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2514  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  100 
 
 
346 aa  707    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1830  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  98.27 
 
 
346 aa  697    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3347  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  74.86 
 
 
346 aa  540  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1238  Tagatose-bisphosphate aldolase  66.18 
 
 
353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0758  Tagatose-bisphosphate aldolase  66.37 
 
 
334 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3960  Tagatose-bisphosphate aldolase  54.14 
 
 
336 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1612  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  54.68 
 
 
331 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1792  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  48.77 
 
 
325 aa  318  7.999999999999999e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.696246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2262  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  48.47 
 
 
326 aa  315  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2223  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  48.47 
 
 
326 aa  315  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0139  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  48.59 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2111  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  48.62 
 
 
335 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0145  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  50.94 
 
 
331 aa  298  8e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000016799  normal  0.130551 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D03  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  45.59 
 
 
326 aa  293  3e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000270283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1928  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  44.75 
 
 
325 aa  290  3e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0079  Tagatose-bisphosphate aldolase  45.29 
 
 
327 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1146  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  45.96 
 
 
317 aa  270  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0514012  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1156  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  33.63 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1345  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  32.06 
 
 
336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1127  tagatose 1,6-diphosphate aldolase-like protein  31.18 
 
 
336 aa  166  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2597  tagatose-bisphosphate aldolase  29.31 
 
 
348 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0798  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  30.77 
 
 
355 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1020  Tagatose-bisphosphate aldolase  29.47 
 
 
329 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2454  Tagatose-bisphosphate aldolase  28.33 
 
 
329 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.214558  normal  0.936143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1950  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.71 
 
 
300 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.524576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2246  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.85 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.101189  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4030  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.06 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3974  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  24 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00258196  normal  0.0292839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1948  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.5 
 
 
294 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1043  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.27 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4232  deoxyribose-phosphate aldolase  26.13 
 
 
292 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4410  deoxyribose-phosphate aldolase  26.13 
 
 
292 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4351  deoxyribose-phosphate aldolase  25.63 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5337  aldolase  24.66 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4254  deoxyribose-phosphate aldolase  25.81 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4345  deoxyribose-phosphate aldolase  25.81 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4299  deoxyribose-phosphate aldolase  25.81 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4138  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.63 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.302553  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4105  deoxyribose-phosphate aldolase  25.63 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5328  deoxyribose-phosphate aldolase  24.38 
 
 
292 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.584894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4266  deoxyribose-phosphate aldolase  25.79 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03715  hypothetical protein  25.47 
 
 
292 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03766  predicted aldolase  25.47 
 
 
292 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4404  deoxyribose-phosphate aldolase  25.47 
 
 
292 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4105  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.47 
 
 
292 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6299  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
385 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.320362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>