126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2498 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  317  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2718  hypothetical protein  85.35 
 
 
157 aa  254  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  44.7 
 
 
144 aa  103  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  40.62 
 
 
133 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  44.19 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  40.58 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  39.16 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  39.86 
 
 
150 aa  97.4  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  39.86 
 
 
150 aa  97.4  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  42.64 
 
 
151 aa  97.1  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  39.53 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  40.31 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  41.27 
 
 
177 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  43.93 
 
 
143 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  42.34 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  42.34 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  38.82 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  38.82 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  38.82 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  42.34 
 
 
145 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  41.82 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.26 
 
 
274 aa  87.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  40.46 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  42.34 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3969  hypothetical protein  38.17 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827845  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  35.88 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  42.45 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  39.06 
 
 
145 aa  85.5  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  41.94 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3955  hypothetical protein  37.4 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4029  hypothetical protein  37.4 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412865  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  40.98 
 
 
311 aa  85.1  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  43.75 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1838  hypothetical protein  42.99 
 
 
162 aa  84  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  41.12 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2238  hypothetical protein  39.1 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  36.18 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  38.28 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  40.95 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  44.76 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  38.24 
 
 
360 aa  81.3  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  36 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1364  hypothetical protein  40.28 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  36.18 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  34.88 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  36.09 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.11 
 
 
306 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  35.88 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2072  hypothetical protein  38.19 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.0346147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  36.57 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5225  hypothetical protein  39.82 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  38.98 
 
 
324 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  33.59 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  34.35 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  34.35 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  34.35 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  43.41 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1321  hypothetical protein  39.16 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.641608  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4262  hypothetical protein  31.65 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.877042  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  33.59 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  33.6 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0254  hypothetical protein  38.05 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2352  hypothetical protein  37.59 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  35.07 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5607  hypothetical protein  35.97 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2738  hypothetical protein  39 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0877362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  37.38 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0172  hypothetical protein  33.1 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  41.22 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1829  hypothetical protein  34.65 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1876  hypothetical protein  34.65 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0838475  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1810  hypothetical protein  34.65 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0179461  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  36.23 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11287  hypothetical protein  35 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91215  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1328  hypothetical protein  40.71 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  38.89 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  31.5 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4618  hypothetical protein  41.12 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168908  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2031  hypothetical protein  40.65 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0287759  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.33 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  37.74 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  37.74 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  37.74 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  35.65 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  34.55 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1820  hypothetical protein  38.21 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2156  hypothetical protein  34.09 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2015  hypothetical protein  39.09 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.364404  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1126  hypothetical protein  34.55 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.331179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0833  hypothetical protein  33.08 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1332  hypothetical protein  40.66 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.223024  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  34.55 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  34.55 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  34.55 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  34.13 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  34.26 
 
 
147 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2456  hypothetical protein  29.01 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13199  hypothetical protein  35.85 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  30.4 
 
 
146 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4153  hypothetical protein  35.71 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>