More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2487 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  100 
 
 
224 aa  439  1e-122  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  95.54 
 
 
224 aa  425  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.79 
 
 
225 aa  341  6e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  2.06018e-08 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  72.97 
 
 
236 aa  321  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  58.74 
 
 
228 aa  258  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  56.25 
 
 
224 aa  256  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.2 
 
 
228 aa  255  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.66 
 
 
233 aa  254  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  58.56 
 
 
227 aa  254  1e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 
224 aa  253  2e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  60.63 
 
 
226 aa  252  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.85 
 
 
224 aa  251  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.5 
 
 
224 aa  243  2e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  52.86 
 
 
228 aa  239  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.05 
 
 
224 aa  239  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.59 
 
 
228 aa  238  7e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  54.91 
 
 
231 aa  238  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  55.16 
 
 
230 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.88235e-09  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  54.46 
 
 
231 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 
224 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 
223 aa  235  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  53.28 
 
 
226 aa  235  5e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 
224 aa  234  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 
224 aa  234  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 
224 aa  234  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  51.8 
 
 
224 aa  234  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 
225 aa  234  1e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.01655e-08 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.05 
 
 
224 aa  233  1e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 
227 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 
224 aa  232  4e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.34276e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  56.09 
 
 
235 aa  231  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  51.26 
 
 
246 aa  231  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 
230 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 
230 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 
230 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  55.66 
 
 
225 aa  230  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 
240 aa  227  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.11909e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  54.71 
 
 
406 aa  227  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 
229 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  49.77 
 
 
223 aa  227  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  50.45 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 
226 aa  225  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 
224 aa  225  5e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  53.51 
 
 
237 aa  224  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  50 
 
 
224 aa  224  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  56.25 
 
 
225 aa  221  5e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  49.55 
 
 
224 aa  222  5e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 
227 aa  221  7e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.5 
 
 
227 aa  221  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  49.1 
 
 
224 aa  219  2e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.92 
 
 
223 aa  220  2e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.82 
 
 
245 aa  219  2e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  58.04 
 
 
229 aa  219  2e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  49.1 
 
 
224 aa  219  2e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.48 
 
 
229 aa  218  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 
273 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  53 
 
 
228 aa  215  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  49.55 
 
 
236 aa  214  6e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 
228 aa  214  1e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 
223 aa  213  1e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 
283 aa  213  2e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  48.89 
 
 
230 aa  212  3e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 
228 aa  212  4e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  3.25236e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  47.75 
 
 
219 aa  211  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 
219 aa  211  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  48.43 
 
 
252 aa  211  8e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 
223 aa  211  8e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  4.06961e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  51.34 
 
 
221 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 
226 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.55 
 
 
271 aa  210  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 
221 aa  209  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 
225 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.4 
 
 
225 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 
225 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4346  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 
384 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0299016  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 
225 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 
237 aa  208  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 
223 aa  208  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  53.81 
 
 
234 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
223 aa  208  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 
232 aa  208  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 
223 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 
248 aa  208  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  49.08 
 
 
224 aa  207  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 
223 aa  207  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  48.65 
 
 
227 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 
223 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  48.65 
 
 
227 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 
231 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  48.65 
 
 
227 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 
223 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 
223 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 
246 aa  206  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.36334e-12  hitchhiker  8.83296e-24 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 
225 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  48.62 
 
 
224 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 
223 aa  205  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.91 
 
 
254 aa  205  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 
246 aa  205  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  46.54 
 
 
222 aa  205  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.95 
 
 
225 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.651671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>