More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2479 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
310 aa  634    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  90.58 
 
 
308 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  69.84 
 
 
307 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  59.15 
 
 
311 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  53.27 
 
 
322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 
306 aa  340  2e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  51 
 
 
306 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  50.67 
 
 
306 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  53.14 
 
 
318 aa  311  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  48.66 
 
 
302 aa  310  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  48.51 
 
 
322 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  47.51 
 
 
305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  44.19 
 
 
303 aa  279  5e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  44.52 
 
 
303 aa  276  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3033  branched-chain amino acid aminotransferase  44.23 
 
 
317 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0183291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  43.32 
 
 
320 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  47.14 
 
 
307 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0408  branched-chain amino acid aminotransferase  39.67 
 
 
303 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  46.13 
 
 
307 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  39.6 
 
 
304 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  43.69 
 
 
308 aa  237  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  45 
 
 
304 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  40.91 
 
 
304 aa  235  9e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  38.61 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  45.45 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  44.67 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  44.33 
 
 
304 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  41.88 
 
 
307 aa  232  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  39.54 
 
 
304 aa  231  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 
305 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  44.52 
 
 
309 aa  229  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  39.48 
 
 
304 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  43.1 
 
 
307 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  39.29 
 
 
304 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  38.96 
 
 
304 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  39.27 
 
 
304 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  44.44 
 
 
307 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  38.96 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  42.14 
 
 
306 aa  225  7e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  42.47 
 
 
317 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10051  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
304 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.299148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0332  branched-chain amino acid aminotransferase  39.67 
 
 
304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0235876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 
307 aa  222  6e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  43.23 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  38.64 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  38.64 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  41.81 
 
 
306 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  41.53 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  42.11 
 
 
306 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 
307 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 
307 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 
306 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 
307 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 
307 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 
307 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 
307 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  38.18 
 
 
304 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.74 
 
 
312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 
309 aa  215  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  40.66 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  40.13 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  38.89 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  40.33 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  40.33 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  40.33 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  40.33 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  40.33 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  40.33 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  40.33 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  40.33 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 
306 aa  212  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 
319 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 
307 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 
309 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  40.19 
 
 
309 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  40.19 
 
 
309 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 
308 aa  207  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  40.19 
 
 
309 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 
307 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  40.19 
 
 
309 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 
307 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 
312 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 
307 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 
306 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  39.67 
 
 
308 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 
307 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 
309 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 
307 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 
307 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.2 
 
 
305 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  40.72 
 
 
308 aa  205  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  40.66 
 
 
308 aa  205  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  39.94 
 
 
312 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  40.13 
 
 
311 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>