More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2468 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.17 
 
 
698 aa  712    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
708 aa  1445    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.96 
 
 
695 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.6 
 
 
698 aa  752    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.12 
 
 
693 aa  688    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  51.29 
 
 
756 aa  703    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.9 
 
 
691 aa  686    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.33 
 
 
699 aa  750    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.02 
 
 
693 aa  878    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  61.29 
 
 
697 aa  875    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.67 
 
 
698 aa  757    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.93 
 
 
697 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.55 
 
 
691 aa  672    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.98 
 
 
698 aa  576  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.03 
 
 
723 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.87 
 
 
724 aa  549  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.62 
 
 
689 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.06 
 
 
691 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.06 
 
 
691 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.34 
 
 
691 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.01 
 
 
718 aa  531  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.02 
 
 
734 aa  525  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.71 
 
 
706 aa  528  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.76 
 
 
691 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.32 
 
 
704 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.11 
 
 
712 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  45.48 
 
 
691 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.05 
 
 
754 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.41 
 
 
729 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.85 
 
 
979 aa  508  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.18 
 
 
749 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.47 
 
 
713 aa  499  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.2 
 
 
762 aa  500  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.06 
 
 
766 aa  497  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.78 
 
 
745 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.6 
 
 
714 aa  497  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.51 
 
 
788 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.96 
 
 
706 aa  494  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.14 
 
 
756 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.19 
 
 
733 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.83 
 
 
708 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.02 
 
 
741 aa  482  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.34 
 
 
706 aa  485  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.72 
 
 
712 aa  480  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.89 
 
 
679 aa  468  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.74 
 
 
448 aa  273  7e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.88 
 
 
602 aa  220  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.34 
 
 
588 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  37.25 
 
 
690 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.33 
 
 
1376 aa  213  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.71 
 
 
563 aa  213  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.55 
 
 
603 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.75 
 
 
716 aa  208  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.12 
 
 
543 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.26 
 
 
543 aa  207  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.26 
 
 
543 aa  207  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.83 
 
 
659 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.46 
 
 
646 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.68 
 
 
593 aa  206  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.68 
 
 
593 aa  206  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  36.64 
 
 
669 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.71 
 
 
646 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.72 
 
 
709 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.68 
 
 
607 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.62 
 
 
630 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  36.97 
 
 
639 aa  203  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.44 
 
 
709 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.35 
 
 
606 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1455  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.82 
 
 
651 aa  203  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865636  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.6 
 
 
633 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.95 
 
 
601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.75 
 
 
568 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.7 
 
 
641 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.76 
 
 
617 aa  200  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  36.69 
 
 
504 aa  200  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.92 
 
 
709 aa  200  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.44 
 
 
634 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.01 
 
 
658 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.01 
 
 
665 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.07 
 
 
599 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.12 
 
 
590 aa  198  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  35.64 
 
 
679 aa  198  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.47 
 
 
556 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.31 
 
 
613 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.69 
 
 
630 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.05 
 
 
622 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.7 
 
 
615 aa  197  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002717  aTP-dependent DNA helicase RecQ family  38.97 
 
 
641 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.88 
 
 
681 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.32 
 
 
607 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.48 
 
 
552 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.32 
 
 
607 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1322  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.88 
 
 
664 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0577384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  34.82 
 
 
654 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.94 
 
 
729 aa  195  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.1 
 
 
641 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1999  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.01 
 
 
658 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.32 
 
 
607 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.82 
 
 
662 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.84 
 
 
562 aa  195  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>