More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2440 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
287 aa  587  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  86.71 
 
 
286 aa  511  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  47.33 
 
 
287 aa  269  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  44.56 
 
 
289 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  44.22 
 
 
289 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  44.48 
 
 
290 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  45.8 
 
 
284 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  46.71 
 
 
301 aa  247  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 
288 aa  241  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  39.16 
 
 
291 aa  229  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  43.11 
 
 
297 aa  222  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  41.61 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  40.64 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  43.77 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  43.58 
 
 
300 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  42.35 
 
 
283 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  43.02 
 
 
308 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  42.65 
 
 
288 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  42.91 
 
 
297 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 
304 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  42.05 
 
 
289 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 
308 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  42.07 
 
 
304 aa  198  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 
288 aa  198  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  38.83 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  38.83 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  39.52 
 
 
288 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 
306 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  41.4 
 
 
287 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  46.75 
 
 
270 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 
289 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  41.3 
 
 
328 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
306 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 
293 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
309 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  39.52 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  39.8 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
293 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 
307 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 
308 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
294 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 
291 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  38.57 
 
 
307 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  36.77 
 
 
299 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.21 
 
 
293 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  35.93 
 
 
308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.12 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
329 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.31 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.31 
 
 
291 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  35.86 
 
 
311 aa  159  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 
319 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 
323 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
308 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  37.02 
 
 
307 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  35.33 
 
 
317 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  35.33 
 
 
317 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 
273 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  36.88 
 
 
317 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  35.33 
 
 
317 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
319 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
323 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  34.11 
 
 
322 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  33.23 
 
 
327 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
307 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  34.53 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  33.11 
 
 
326 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 
311 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
305 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 
288 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
292 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  36.78 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  35.27 
 
 
494 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 
296 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
303 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 
310 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
276 aa  135  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0522  Alpha/beta hydrolase fold-1  40.51 
 
 
241 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  34.81 
 
 
277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  36.06 
 
 
274 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
309 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
303 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 
294 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  33.23 
 
 
323 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  32.73 
 
 
296 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  33.23 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>