112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2416 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  55.34 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  55.1 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  52 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  52.22 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  50.51 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  50.52 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  45.45 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  45.45 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  46.46 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  48.42 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  42.27 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  44.9 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  42.27 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  61.19 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  42 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  46.39 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  44.09 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  44.09 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  44.44 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  86.05 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  45.26 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  43.56 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  37.63 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  39.8 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  39.81 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  36.08 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  39.58 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  36.63 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  41.3 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  44.93 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  36.46 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  39.08 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  41.33 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  36.73 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.1 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  38.57 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  32.29 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  42.86 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  33.66 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  36.56 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  34.25 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  40.96 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  32.32 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  37.63 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  39.13 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  42.03 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  39.36 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  31.71 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  39.29 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  29.07 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  33.87 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  32.26 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.71 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  34.15 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  37.18 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  37.65 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  31.65 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  35.8 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  35.8 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  30.95 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  41.07 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  43.33 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  31.11 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  30.65 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  36.99 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  32.93 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  38.37 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  32.5 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  35.9 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 		 96 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  37.7 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>