243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2377 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 938 aa  1912    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  45.11 
 
 		 931 aa  749    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.08 
 
 		 929 aa  1001    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  52.67 
 
 		 933 aa  909    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  84.11 
 
 		 952 aa  1591    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  41.34 
 
 		 906 aa  615  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.03 
 
 		 946 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.03 
 
 		 946 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.03 
 
 		 946 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.87 
 
 		 933 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.64 
 
 		 929 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.92 
 
 		 937 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.71 
 
 		 947 aa  588  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.51 
 
 		 929 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.59 
 
 		 928 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.68 
 
 		 933 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.25 
 
 		 949 aa  585  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.78 
 
 		 937 aa  582  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.87 
 
 		 928 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.96 
 
 		 936 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.27 
 
 		 1001 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.44 
 
 		 1002 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.77 
 
 		 936 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.8 
 
 		 921 aa  577  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.62 
 
 		 950 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.45 
 
 		 945 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.29 
 
 		 951 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  40 
 
 		 918 aa  571  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.92 
 
 		 957 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.84 
 
 		 985 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.36 
 
 		 938 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.98 
 
 		 926 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.01 
 
 		 1038 aa  560  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.06 
 
 		 1004 aa  557  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.08 
 
 		 1088 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.17 
 
 		 923 aa  556  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.89 
 
 		 1075 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.85 
 
 		 949 aa  558  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.74 
 
 		 896 aa  553  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.02 
 
 		 1017 aa  553  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.47 
 
 		 994 aa  555  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 		 994 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.58 
 
 		 1030 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.06 
 
 		 1009 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.17 
 
 		 1009 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.02 
 
 		 949 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.17 
 
 		 930 aa  555  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.06 
 
 		 934 aa  555  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.01 
 
 		 994 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2699  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.27 
 
 		 915 aa  550  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 		 1008 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.31 
 
 		 970 aa  551  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.23 
 
 		 1018 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.01 
 
 		 994 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.01 
 
 		 994 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.01 
 
 		 994 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.01 
 
 		 1024 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.01 
 
 		 994 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.31 
 
 		 929 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.91 
 
 		 1085 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.29 
 
 		 938 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.06 
 
 		 1017 aa  546  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.31 
 
 		 929 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.51 
 
 		 920 aa  548  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.81 
 
 		 932 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.01 
 
 		 998 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.57 
 
 		 947 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.77 
 
 		 982 aa  547  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.9 
 
 		 998 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.41 
 
 		 937 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 		 954 aa  545  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.51 
 
 		 1002 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.09 
 
 		 929 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.06 
 
 		 896 aa  542  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.74 
 
 		 1009 aa  542  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.51 
 
 		 1007 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.95 
 
 		 1023 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38 
 
 		 946 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.29 
 
 		 994 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.68 
 
 		 940 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.43 
 
 		 994 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 		 939 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.12 
 
 		 892 aa  533  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.29 
 
 		 997 aa  536  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.94 
 
 		 831 aa  533  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.14 
 
 		 898 aa  532  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.81 
 
 		 995 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.58 
 
 		 954 aa  531  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.28 
 
 		 972 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.55 
 
 		 989 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.89 
 
 		 928 aa  528  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.79 
 
 		 883 aa  529  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.93 
 
 		 989 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.95 
 
 		 1021 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.04 
 
 		 898 aa  523  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.25 
 
 		 897 aa  525  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.08 
 
 		 900 aa  525  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.67 
 
 		 981 aa  525  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.18 
 
 		 989 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.44 
 
 		 1006 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>