More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2336 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  100 
 
 		 498 aa  1011    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  87.15 
 
 		 498 aa  886    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  46.23 
 
 		 503 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  43.92 
 
 		 537 aa  372  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  37.77 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  40.63 
 
 		 543 aa  324  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  39.96 
 
 		 512 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  38.7 
 
 		 558 aa  304  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  35.1 
 
 		 562 aa  300  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  35.62 
 
 		 553 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  36.17 
 
 		 555 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  35.94 
 
 		 554 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  35.81 
 
 		 554 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  35.94 
 
 		 554 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  35.88 
 
 		 592 aa  294  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  35.94 
 
 		 554 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  35.74 
 
 		 554 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  35.74 
 
 		 554 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  36.91 
 
 		 554 aa  293  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  36.4 
 
 		 554 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  35.59 
 
 		 552 aa  291  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  35.55 
 
 		 554 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  35.55 
 
 		 554 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  35.55 
 
 		 554 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  35.55 
 
 		 554 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  35.94 
 
 		 554 aa  290  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  35.94 
 
 		 554 aa  289  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  35.35 
 
 		 554 aa  289  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.55 
 
 		 554 aa  289  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  35.55 
 
 		 554 aa  289  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  35.55 
 
 		 554 aa  289  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  37.37 
 
 		 554 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  35.98 
 
 		 554 aa  289  9e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  37.37 
 
 		 554 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  36.95 
 
 		 554 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  37.37 
 
 		 554 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  35.35 
 
 		 554 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  36.97 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  36.95 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  36.91 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  36.44 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  37.16 
 
 		 554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  36.95 
 
 		 554 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  35.81 
 
 		 554 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  36.63 
 
 		 537 aa  286  7e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  34.85 
 
 		 557 aa  286  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  37.04 
 
 		 556 aa  285  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  35.62 
 
 		 554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  35.65 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  37.83 
 
 		 554 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  36.11 
 
 		 555 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  34.96 
 
 		 554 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  36.14 
 
 		 571 aa  282  8.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  35.03 
 
 		 554 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  35.03 
 
 		 554 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  35.03 
 
 		 554 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  35.16 
 
 		 554 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  35.16 
 
 		 554 aa  276  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  36.8 
 
 		 556 aa  276  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  36.23 
 
 		 556 aa  273  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  39.53 
 
 		 564 aa  272  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  35.55 
 
 		 596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  36.73 
 
 		 563 aa  270  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  36.54 
 
 		 563 aa  270  4e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  35.74 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.65 
 
 		 528 aa  267  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  36.66 
 
 		 563 aa  259  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  32.08 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  36.24 
 
 		 530 aa  249  6e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  36.73 
 
 		 638 aa  248  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  36.81 
 
 		 488 aa  233  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.76 
 
 		 510 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.76 
 
 		 510 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.76 
 
 		 510 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.76 
 
 		 510 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.98 
 
 		 510 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.76 
 
 		 510 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.76 
 
 		 510 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.83 
 
 		 595 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.33 
 
 		 588 aa  224  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.4 
 
 		 610 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.82 
 
 		 602 aa  223  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  31.48 
 
 		 632 aa  222  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  37.47 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  37.47 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  37.47 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  37.47 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  31.48 
 
 		 632 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  37.47 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  37.47 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.47 
 
 		 633 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  37.47 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  37.47 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.36 
 
 		 598 aa  220  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  35.7 
 
 		 594 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.53 
 
 		 664 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.03 
 
 		 591 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.21 
 
 		 633 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.72 
 
 		 592 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.39 
 
 		 598 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>