27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2277 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  43.71 
 
 
1011 aa  664    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  100 
 
 
914 aa  1847    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  82.68 
 
 
1065 aa  1470    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  30.77 
 
 
748 aa  280  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  26.58 
 
 
1157 aa  197  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  35.51 
 
 
641 aa  196  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  30.29 
 
 
657 aa  178  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  32.65 
 
 
766 aa  158  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  29.09 
 
 
1224 aa  135  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  30.66 
 
 
640 aa  128  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  30.28 
 
 
802 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  30.41 
 
 
624 aa  125  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  25.43 
 
 
979 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  41.18 
 
 
429 aa  107  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  26.23 
 
 
488 aa  100  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  26.03 
 
 
630 aa  97.8  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  26.21 
 
 
431 aa  97.1  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  24.41 
 
 
522 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  23.92 
 
 
522 aa  92  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  26.12 
 
 
359 aa  84.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  25.56 
 
 
623 aa  82.4  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2808  alpha-clostripain-like protein  24.91 
 
 
406 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  25.24 
 
 
310 aa  76.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1457  hypothetical protein  27.33 
 
 
904 aa  64.3  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  24.7 
 
 
679 aa  56.2  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0349  hypothetical protein  24.7 
 
 
399 aa  47.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.286658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  26.67 
 
 
431 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>