More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2265 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 400 aa  763    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  40.27 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  40.27 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  40.27 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  40.27 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  40.27 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  40 
 
 		 375 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  40.54 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  40.21 
 
 		 445 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  40 
 
 		 375 aa  252  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  37.87 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  39.79 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  39.79 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  39.79 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  39.53 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  39.53 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  40.16 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  39.53 
 
 		 387 aa  249  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  39.53 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  39.53 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  39.28 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  40.27 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  40 
 
 		 375 aa  243  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  40 
 
 		 375 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  36.34 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  44.47 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.53 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  38.24 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  40.21 
 
 		 412 aa  222  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.27 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  38.7 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  36.99 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  35.14 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  34.93 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  35.32 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  35.02 
 
 		 469 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  33.57 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.01 
 
 		 427 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  35.16 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  36.91 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  30.91 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 		 474 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  29.74 
 
 		 414 aa  166  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  34.91 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  31.81 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  35.37 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  29.47 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.39 
 
 		 352 aa  160  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 748 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  34.2 
 
 		 473 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  38.54 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 		 749 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  38.05 
 
 		 485 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  37.17 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  37.86 
 
 		 413 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  31.48 
 
 		 320 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  29.49 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 		 586 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  30.24 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 586 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 586 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  30.31 
 
 		 398 aa  140  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  29.87 
 
 		 585 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.24 
 
 		 587 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 756 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  29.87 
 
 		 585 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 		 585 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  31.49 
 
 		 479 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  30.31 
 
 		 585 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 		 513 aa  136  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.2 
 
 		 587 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.05 
 
 		 585 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  30.41 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  35.49 
 
 		 683 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 		 750 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  30.22 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 587 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  31.3 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  28.11 
 
 		 775 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>