More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2261 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  83.21 
 
 
418 aa  701    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
430 aa  855    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2329  glycosyl transferase group 1  56.8 
 
 
419 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0153585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2957  glycosyl transferase group 1  51.92 
 
 
435 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3362  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
393 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2749  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
393 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1131  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
411 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.05 
 
 
388 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.61 
 
 
404 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
387 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
398 aa  99.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  21.5 
 
 
392 aa  97.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
375 aa  96.7  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
384 aa  96.7  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
394 aa  96.3  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 
353 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  18.52 
 
 
396 aa  94  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 
419 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
748 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
426 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
420 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  37.22 
 
 
377 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.52 
 
 
365 aa  90.5  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
379 aa  90.1  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
377 aa  90.1  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
373 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  26.17 
 
 
417 aa  89.7  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
379 aa  89.7  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  28.46 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
379 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
360 aa  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
412 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
446 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  31.33 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
408 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
413 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  28.66 
 
 
404 aa  87.8  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
408 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
408 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 
375 aa  87  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
351 aa  87  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
440 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  28.41 
 
 
402 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3577  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
377 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
411 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
412 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
385 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  26.88 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  37.27 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.42 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  37.16 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  22.63 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  27.66 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
362 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  32.45 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  23.93 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  23.93 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  25.29 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  31.33 
 
 
384 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  28.83 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  22.81 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  21.62 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2693  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.25 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.19 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>