More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2176 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  100 
 
 		 398 aa  795    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1796  ABC transporter related  74.19 
 
 		 393 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165895  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1368  ABC transporter related  56.72 
 
 		 385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1822  ABC transporter related  39.57 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  34.47 
 
 		 380 aa  213  7e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  34.19 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0570  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.39 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 		 362 aa  209  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  37.69 
 
 		 379 aa  209  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  34.45 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  40.64 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  34.27 
 
 		 380 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.96 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.65 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2235  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.75 
 
 		 364 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.16 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  40.88 
 
 		 360 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 358 aa  203  5e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2547  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.75 
 
 		 364 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370363  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  40.12 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1216  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding subunit  40.73 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.32 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.38 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  36.01 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 361 aa  201  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.73 
 
 		 361 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 353 aa  199  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  32.2 
 
 		 367 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.75 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1403  ABC transporter related protein  34.54 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.579406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  36.95 
 
 		 348 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.24 
 
 		 368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  37.28 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  42.55 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.32 
 
 		 378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.32 
 
 		 378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.32 
 
 		 378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  37.33 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.82 
 
 		 376 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  33.69 
 
 		 368 aa  196  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  40.99 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  40.62 
 
 		 337 aa  196  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 357 aa  196  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1159  ABC transporter related  34.31 
 
 		 364 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000201469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1181  ABC transporter related  34.31 
 
 		 364 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000170044  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.29 
 
 		 377 aa  195  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.54 
 
 		 371 aa  195  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.62 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  36.66 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.62 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.73 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.62 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  37.11 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  37.62 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.62 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  37.71 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.62 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  35.95 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.7 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  36.95 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  39.75 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  41.05 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  35.9 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  40.59 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.49 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  40.77 
 
 		 353 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1467  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.8 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765075  hitchhiker  0.0000000331128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  40.19 
 
 		 352 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.85 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  37.71 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.81 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  40.89 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  39.62 
 
 		 602 aa  193  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  35.26 
 
 		 353 aa  193  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.81 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.45 
 
 		 382 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  41.67 
 
 		 362 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.8 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1932  ABC transporter related  34.75 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0195576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.65 
 
 		 384 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.9 
 
 		 371 aa  192  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  36.73 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  39.33 
 
 		 360 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2048  ABC transporter component  40.59 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  44.15 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  40.74 
 
 		 347 aa  192  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.08 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  39.87 
 
 		 352 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  35.65 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.87 
 
 		 352 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  34.92 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5428  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.59 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.48813  normal  0.102518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  34.92 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  45.67 
 
 		 209 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>