79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2170 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  79.14 
 
 		 676 aa  1120    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 		 676 aa  1367    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6094  Glycogen debranching protein-like protein  23.43 
 
 		 815 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0311  glycogen debranching protein  25.72 
 
 		 869 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.38 
 
 		 746 aa  102  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.57 
 
 		 868 aa  101  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  26.16 
 
 		 834 aa  90.9  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  25 
 
 		 723 aa  84.7  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.44 
 
 		 751 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.66 
 
 		 724 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.95 
 
 		 741 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  25.29 
 
 		 729 aa  77.8  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  22.16 
 
 		 758 aa  76.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.62 
 
 		 725 aa  76.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.08 
 
 		 731 aa  74.3  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.08 
 
 		 760 aa  73.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.48 
 
 		 729 aa  73.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.58 
 
 		 734 aa  72  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  22.19 
 
 		 727 aa  72.4  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.95 
 
 		 734 aa  70.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.37 
 
 		 732 aa  70.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.88 
 
 		 732 aa  70.5  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.38 
 
 		 723 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.39 
 
 		 698 aa  70.5  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.95 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.07 
 
 		 781 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.92 
 
 		 732 aa  68.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  23.63 
 
 		 733 aa  67.8  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.76 
 
 		 720 aa  66.6  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.62 
 
 		 708 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1705  hypothetical protein  23.44 
 
 		 706 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.410139  hitchhiker  0.00605437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.45 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.85 
 
 		 735 aa  63.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.28 
 
 		 736 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.17 
 
 		 751 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  25 
 
 		 751 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.36 
 
 		 735 aa  62  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.67 
 
 		 741 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  24.94 
 
 		 751 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25 
 
 		 721 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.86 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.26 
 
 		 736 aa  58.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.75 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2294  hypothetical protein  25.74 
 
 		 735 aa  56.6  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.922651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2343  hypothetical protein  21.85 
 
 		 677 aa  55.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266376  decreased coverage  0.000000338267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.4 
 
 		 716 aa  55.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  22.58 
 
 		 810 aa  54.3  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22 
 
 		 711 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.43 
 
 		 722 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.39 
 
 		 658 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.01 
 
 		 778 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.99 
 
 		 717 aa  51.6  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.9 
 
 		 685 aa  51.6  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1627  hypothetical protein  24.71 
 
 		 692 aa  51.2  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.8 
 
 		 733 aa  50.8  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  19.91 
 
 		 718 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.45 
 
 		 759 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4269  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1200 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0489651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.5 
 
 		 764 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.41 
 
 		 685 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.16 
 
 		 765 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.96 
 
 		 719 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  23.18 
 
 		 674 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  23.57 
 
 		 955 aa  47.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.65 
 
 		 757 aa  47.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4224  hypothetical protein  19.84 
 
 		 1136 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  26.27 
 
 		 509 aa  47.4  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.22 
 
 		 776 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.27 
 
 		 733 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.47 
 
 		 741 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  28.42 
 
 		 363 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.71 
 
 		 778 aa  47.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.43 
 
 		 734 aa  46.2  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.42 
 
 		 778 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.84 
 
 		 733 aa  45.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  24.13 
 
 		 839 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.54 
 
 		 740 aa  44.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.44 
 
 		 623 aa  44.3  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.07 
 
 		 700 aa  43.9  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>