More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2157 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
335 aa  685    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.01 
 
 
335 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.94 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 
346 aa  389  1e-107  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
351 aa  379  1e-104  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 
333 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 
337 aa  352  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
356 aa  328  8e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
356 aa  328  8e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
331 aa  323  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  48.04 
 
 
331 aa  317  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  49.4 
 
 
342 aa  309  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 
329 aa  309  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  48.7 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  48.39 
 
 
346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
325 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
323 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
330 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  47.09 
 
 
341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  46.88 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
323 aa  282  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
340 aa  282  7.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  47.77 
 
 
340 aa  280  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
326 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  48.01 
 
 
346 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
342 aa  280  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  48.01 
 
 
346 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  45.22 
 
 
341 aa  280  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  48.01 
 
 
346 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
328 aa  279  4e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
328 aa  279  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  48.01 
 
 
346 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  48.01 
 
 
346 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  48.01 
 
 
346 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  48.01 
 
 
346 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
327 aa  278  9e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
359 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
326 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
324 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  47.18 
 
 
342 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
327 aa  275  8e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
348 aa  273  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
354 aa  272  7e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  46.83 
 
 
342 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.99 
 
 
341 aa  268  8.999999999999999e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1026  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.94 
 
 
345 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003890  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
340 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  46.22 
 
 
342 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
330 aa  267  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.35 
 
 
339 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  46.9 
 
 
337 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6416  tryptophanyl-tRNA synthetase II  46.9 
 
 
337 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6975  tryptophanyl-tRNA synthetase II  46.61 
 
 
337 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  46.61 
 
 
337 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  46.61 
 
 
337 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.87 
 
 
339 aa  266  5e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
327 aa  265  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7076  tryptophanyl-tRNA synthetase II  46.61 
 
 
337 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
329 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
329 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
340 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  46.06 
 
 
335 aa  262  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0512  tryptophanyl-tRNA synthetase II  47.71 
 
 
346 aa  262  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4909  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.99 
 
 
337 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.229127  normal  0.0358583 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.57 
 
 
357 aa  262  8e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4912  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.99 
 
 
337 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4762  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.99 
 
 
337 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4838  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.99 
 
 
337 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
330 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4862  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.68 
 
 
337 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.217158 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
329 aa  258  9e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
328 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
329 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01774  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.28 
 
 
340 aa  255  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2364  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.56 
 
 
333 aa  252  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
331 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0485  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.99 
 
 
334 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
328 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
329 aa  245  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
325 aa  239  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
330 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
331 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
331 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
327 aa  235  9e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
404 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
404 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
373 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
332 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12310  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
358 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.846679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
400 aa  228  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>