295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2128 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2128  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
691 aa  1309    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.66852  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3499  PASTA domain-containing protein  60.14 
 
 
583 aa  430  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3034  protein serine/threonine phosphatase  40.44 
 
 
527 aa  157  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.73 
 
 
470 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  38.21 
 
 
449 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1366  protein serine/threonine phosphatase  34.88 
 
 
280 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.41 
 
 
611 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  33.58 
 
 
574 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
321 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  32 
 
 
319 aa  99  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  34.38 
 
 
597 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
267 aa  94  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  34.14 
 
 
415 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3435  protein serine/threonine phosphatases  32.82 
 
 
281 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1226  putative protein serine/threonine phosphatase  30.27 
 
 
624 aa  90.9  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  31.8 
 
 
386 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  34.1 
 
 
389 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  32.08 
 
 
256 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  32.09 
 
 
435 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  36.59 
 
 
305 aa  88.6  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  30.16 
 
 
239 aa  88.2  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  30.8 
 
 
548 aa  87.8  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.51 
 
 
237 aa  87.4  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  28.95 
 
 
280 aa  87.4  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  32.08 
 
 
254 aa  87.4  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4022  protein serine/threonine phosphatase  32.22 
 
 
642 aa  87  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0619  putative protein serine/threonine phosphatase  29.6 
 
 
733 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163625  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  29.48 
 
 
236 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  30.31 
 
 
258 aa  86.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2391  protein serine/threonine phosphatase  36.59 
 
 
422 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  30.71 
 
 
320 aa  86.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  31.2 
 
 
252 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  31.18 
 
 
256 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  29.88 
 
 
239 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  30.8 
 
 
256 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  30.8 
 
 
256 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.57 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  29.82 
 
 
571 aa  85.1  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  30.91 
 
 
680 aa  84.7  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  34.12 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3475  protein serine/threonine phosphatase  30.22 
 
 
781 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  33.21 
 
 
293 aa  84  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  28.2 
 
 
538 aa  84  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2329  putative protein serine/threonine phosphatase  30.22 
 
 
669 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.580462  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  31.05 
 
 
519 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
241 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2278  putative protein serine/threonine phosphatase  30.22 
 
 
669 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  30.56 
 
 
238 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1283  protein serine/threonine phosphatase  30.53 
 
 
482 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.646496  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  30.59 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  31.62 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  26.74 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  31.91 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  32.58 
 
 
264 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  31.58 
 
 
256 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  34.01 
 
 
348 aa  83.2  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  26.82 
 
 
245 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  31 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0026  putative protein serine/threonine phosphatase  30.83 
 
 
651 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  31.4 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  31.44 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  27.8 
 
 
271 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  31.44 
 
 
280 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  33.72 
 
 
292 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  31.35 
 
 
252 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  31.44 
 
 
280 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  30.37 
 
 
241 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  33.02 
 
 
236 aa  79  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  30.88 
 
 
276 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2278  protein serine/threonine phosphatase  29.71 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.591939 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.16 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  33.81 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2765  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.8 
 
 
419 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  32.68 
 
 
452 aa  76.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  32.06 
 
 
256 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.34 
 
 
516 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  30.33 
 
 
478 aa  76.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  32.73 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  30.95 
 
 
477 aa  76.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.93 
 
 
517 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  33.2 
 
 
265 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  28.23 
 
 
241 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  30.86 
 
 
253 aa  75.5  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.66 
 
 
238 aa  75.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  30.9 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3487  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.928311  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  35.17 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.89 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.86 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4386  protein serine/threonine phosphatases  32.35 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  27.65 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  34.25 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  29.69 
 
 
426 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  29.96 
 
 
441 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  27.67 
 
 
250 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  32.08 
 
 
266 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6845  cyclic nucleotide-binding protein  28.87 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  29.74 
 
 
296 aa  72  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  30.56 
 
 
256 aa  72.4  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  31 
 
 
241 aa  72.4  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>