More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2076 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 380 aa  780    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  69.92 
 
 		 380 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  45.19 
 
 		 380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  44.78 
 
 		 376 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  45.48 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  44.33 
 
 		 380 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  44.42 
 
 		 380 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  44.59 
 
 		 380 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  44.66 
 
 		 373 aa  288  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  44.56 
 
 		 406 aa  288  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  43.86 
 
 		 361 aa  288  9e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1755  transposase, IS605 OrfB family  43.54 
 
 		 371 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  42.22 
 
 		 466 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  44.89 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  43.01 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  42.3 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1741  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  45.28 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  39.85 
 
 		 399 aa  245  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  40.1 
 
 		 399 aa  242  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  41.12 
 
 		 399 aa  235  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.25 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.82 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  33.51 
 
 		 424 aa  223  4e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  36.26 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  36.39 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 		 401 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.47 
 
 		 399 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  37.47 
 
 		 399 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  35.58 
 
 		 402 aa  205  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  37.33 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  36.61 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  35.42 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  33.06 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  36.07 
 
 		 370 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  33.15 
 
 		 370 aa  199  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  32.97 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  33.42 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3012  transposase, IS605 OrfB family  34.19 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  32.97 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  33.24 
 
 		 363 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  32.97 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  32.61 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  32.97 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  32.97 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  33.42 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  33.06 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  32.97 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  32.88 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  33.16 
 
 		 370 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  32.88 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  34.96 
 
 		 384 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  32.97 
 
 		 363 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  32.69 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2858  transposase, IS605 OrfB family  36.27 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.551858  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  36.96 
 
 		 368 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  32.61 
 
 		 393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  32.28 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  32.88 
 
 		 370 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  34.43 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  34.43 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  34.43 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  34.43 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  32.88 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  36.04 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  35 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2570  transposase, IS605 OrfB family  34.21 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373055  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  33.96 
 
 		 394 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  33.15 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  33.15 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  33.97 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  33.15 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  33.15 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  33.15 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  36.44 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  34.43 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1635  IS891/IS1136/IS1341 transposase  37.62 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  33.15 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  33.15 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  34.9 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  34.52 
 
 		 367 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  32.6 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  31.15 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  32.6 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  31.15 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  33.15 
 
 		 391 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  31.15 
 
 		 384 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  31.49 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  34.32 
 
 		 391 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.97 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  31.15 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  34.52 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  33.86 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  32.61 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2486  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32.97 
 
 		 380 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  30.89 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.25 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  30.75 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  30.89 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>