More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2073 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
308 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  90.85 
 
 
308 aa  555  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  65.66 
 
 
315 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  64.98 
 
 
315 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  65.2 
 
 
315 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  66.33 
 
 
315 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  60.54 
 
 
305 aa  363  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  58.36 
 
 
312 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  55.05 
 
 
305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  57.53 
 
 
302 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  55.25 
 
 
320 aa  334  9e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  59.61 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  55.14 
 
 
330 aa  315  9e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  54.93 
 
 
376 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  60.36 
 
 
314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  54.8 
 
 
300 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  48.61 
 
 
313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  53 
 
 
293 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  48.93 
 
 
302 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  49.15 
 
 
296 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  46.93 
 
 
316 aa  241  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  47.16 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  49.82 
 
 
339 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  46.48 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  47.52 
 
 
304 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 
332 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  45.55 
 
 
312 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  46.1 
 
 
306 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  48.69 
 
 
305 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  41.05 
 
 
304 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 
295 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  43.57 
 
 
305 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 
319 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 
319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 
295 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  43.59 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 
295 aa  212  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 
346 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  39.02 
 
 
296 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 
293 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  42.76 
 
 
302 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  42.76 
 
 
302 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  46.77 
 
 
295 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  40.74 
 
 
302 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  43.26 
 
 
295 aa  205  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 
295 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  40.91 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 
328 aa  199  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  39.65 
 
 
304 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  36.96 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  43.71 
 
 
295 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  35.91 
 
 
302 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 
309 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  40.28 
 
 
327 aa  188  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  36.26 
 
 
285 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  34.43 
 
 
323 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 
332 aa  185  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  36.75 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  37.99 
 
 
307 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  37.67 
 
 
303 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  37.01 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 
331 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  35.23 
 
 
307 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  34.29 
 
 
317 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  39.01 
 
 
295 aa  165  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  41.57 
 
 
325 aa  165  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  35.42 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  34.66 
 
 
326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  42.03 
 
 
295 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  34.44 
 
 
331 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  40.97 
 
 
295 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  37.92 
 
 
285 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  37.32 
 
 
315 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 
327 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
292 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  29.23 
 
 
301 aa  146  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  33.81 
 
 
297 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  31.52 
 
 
296 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  41.67 
 
 
295 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  31.52 
 
 
296 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  35.29 
 
 
293 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  31.52 
 
 
296 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  33.09 
 
 
297 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  33.91 
 
 
310 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
312 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  31.64 
 
 
290 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 
338 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  29.03 
 
 
314 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  30.63 
 
 
302 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
476 aa  136  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  31.41 
 
 
293 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  36.01 
 
 
481 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  29.55 
 
 
300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  30.29 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>