More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2070 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  94.68 
 
 		 395 aa  758    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 395 aa  787    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  76.19 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  72.66 
 
 		 394 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  64.97 
 
 		 393 aa  500  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  61.52 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  62.09 
 
 		 394 aa  489  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  61.27 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  61.58 
 
 		 393 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  58.73 
 
 		 394 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  59.49 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  59.9 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  58.48 
 
 		 394 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  58.73 
 
 		 394 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  58.48 
 
 		 394 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  58.23 
 
 		 394 aa  471  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  57.97 
 
 		 394 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  57.97 
 
 		 394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  57.72 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  57.97 
 
 		 394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  61.52 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  57.72 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  57.72 
 
 		 394 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  58.63 
 
 		 392 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  58.99 
 
 		 395 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  58.48 
 
 		 394 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  59.06 
 
 		 402 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  58.56 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  58.6 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  58.6 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  58.31 
 
 		 401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  58.56 
 
 		 401 aa  448  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  58.12 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  56.68 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  56.68 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.7 
 
 		 646 aa  441  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  57.82 
 
 		 401 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  55.94 
 
 		 402 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  56.64 
 
 		 650 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  56.19 
 
 		 402 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  55.33 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  55.33 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  54.84 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  54.27 
 
 		 399 aa  433  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  58.56 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  56.89 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  55.5 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  57.14 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  54.52 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  55.89 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  53.52 
 
 		 399 aa  425  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  55.56 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  54.5 
 
 		 399 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  55.97 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  53.55 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  54.68 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  53.02 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  57.84 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.27 
 
 		 655 aa  419  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  55.05 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 		 395 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  52.91 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  53.52 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  53.44 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  53.44 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  51.39 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  55.95 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  56.2 
 
 		 389 aa  418  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  57.14 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  53.4 
 
 		 398 aa  413  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  52.02 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  53.16 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  56.33 
 
 		 400 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  55.9 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  54.77 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  55.61 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  54.27 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  51.39 
 
 		 395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  54.27 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  53.05 
 
 		 403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  52.63 
 
 		 403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  54.08 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  54.89 
 
 		 397 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  55.36 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  54.66 
 
 		 396 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  55.64 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  53.05 
 
 		 396 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  52.15 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  53.81 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  55.33 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  52.03 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  50.87 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  51.14 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  52.45 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  51.55 
 
 		 399 aa  391  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  52.39 
 
 		 389 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>