More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2065 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  87.66 
 
 		 462 aa  793    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 462 aa  924    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  53.28 
 
 		 456 aa  467  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  49.89 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 		 284 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 308 aa  117  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 240 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  34.05 
 
 		 265 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.31 
 
 		 285 aa  103  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 339 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 275 aa  101  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.04 
 
 		 312 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 504 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 		 299 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 314 aa  99.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 286 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 301 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 273 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 324 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 474 aa  96.3  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 340 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 323 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  28.67 
 
 		 306 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 		 344 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 296 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 309 aa  94.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 333 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 296 aa  94.4  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 265 aa  94.4  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 291 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 287 aa  94  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 287 aa  93.2  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 279 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 340 aa  93.2  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  30.66 
 
 		 303 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 295 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 329 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 284 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 271 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 309 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 280 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.06 
 
 		 380 aa  90.1  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 323 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 279 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 315 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  28.42 
 
 		 279 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.47 
 
 		 262 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 279 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 279 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 279 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.54 
 
 		 295 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 291 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 291 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 291 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 279 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 		 275 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.72 
 
 		 315 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.72 
 
 		 315 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  28.07 
 
 		 279 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 310 aa  87.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 		 261 aa  87.4  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 294 aa  87.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 303 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 327 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  28.68 
 
 		 279 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 260 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 298 aa  86.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 280 aa  86.7  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  23.55 
 
 		 300 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 		 290 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 290 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23 
 
 		 300 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.5 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  25.58 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.57 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  28.83 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.17 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  22.97 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  23.31 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.61 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.01 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>