113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2035 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2035  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1762  hypothetical protein  88.39 
 
 		 268 aa  494  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0067  hypothetical protein  34.98 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  32.8 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4882  hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  33.2 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  32.81 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  37.29 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  32.02 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  30.49 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  30.74 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  35.03 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3882  hypothetical protein  29.02 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000462301  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  28.08 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  34.83 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  31.31 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  29.91 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  34.08 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  32.77 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  27.24 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  33.9 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  31.94 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  31.79 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  33.33 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  27.7 
 
 		 270 aa  92  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  33.33 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  29.96 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  28.79 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  28.71 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  33.16 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  30.54 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  33.14 
 
 		 182 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  31.2 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  29.17 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  27.14 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  32.2 
 
 		 263 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3589  protein of unknown function DUF574  27.07 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.801624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  30.69 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  31.02 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  29.39 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  30.17 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  33.16 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  31.82 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  30.73 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  29.76 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  36.18 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  34.08 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  27.35 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  32.58 
 
 		 274 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  35.68 
 
 		 268 aa  85.5  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  27.68 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  34.33 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  31.84 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  27.08 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  28.9 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  28.5 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  29.24 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  29.91 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  29.67 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  25.99 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  35.1 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  29.69 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  29.57 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  27.59 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  28.51 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  32.61 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  31.25 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  25.94 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  29.58 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  28.25 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  31.88 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  29.1 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  30.72 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  35.38 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  29.21 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  28.57 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  31.32 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  29.17 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  27.71 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  26.78 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  36.69 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  31.07 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  33.71 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  26.34 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4033  hypothetical protein  40.86 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3635  hypothetical protein  37.96 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  29.46 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  30.05 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  34.11 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  28.3 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  34.44 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  26.82 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  34.11 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0569  hypothetical protein  41.94 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  37.5 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0769  protein of unknown function DUF574  26.98 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  30.63 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  26.64 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  25.42 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>