134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2024 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  89.26 
 
 		 488 aa  867    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 490 aa  979    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  52.37 
 
 		 476 aa  468  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  40.38 
 
 		 479 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  38.44 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  36.7 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  36.48 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  39.2 
 
 		 491 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  36.91 
 
 		 473 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  36.36 
 
 		 473 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  36.7 
 
 		 473 aa  317  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  36.7 
 
 		 473 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  36.7 
 
 		 473 aa  316  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  36.7 
 
 		 473 aa  316  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  35.55 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  35.34 
 
 		 473 aa  302  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  36.5 
 
 		 456 aa  299  9e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  38.63 
 
 		 460 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  37.71 
 
 		 509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  36.82 
 
 		 495 aa  272  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  36.38 
 
 		 469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  35.23 
 
 		 469 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  32.48 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  32.48 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  37.56 
 
 		 459 aa  262  8e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  30.56 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  34.66 
 
 		 471 aa  253  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  34.39 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  35.48 
 
 		 470 aa  233  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  35.11 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  34.58 
 
 		 470 aa  229  7e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  37.05 
 
 		 482 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  36.79 
 
 		 479 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  32.83 
 
 		 469 aa  216  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  36.71 
 
 		 477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  33.54 
 
 		 470 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  36.7 
 
 		 473 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  26.43 
 
 		 466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  26.94 
 
 		 463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  26.53 
 
 		 466 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  26 
 
 		 466 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  27.16 
 
 		 463 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  26.79 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  34.82 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  31.75 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  26.32 
 
 		 466 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  26.32 
 
 		 466 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  26.57 
 
 		 466 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  31.65 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  26 
 
 		 466 aa  206  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  25.75 
 
 		 466 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  32.37 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  35.41 
 
 		 463 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  33.26 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 446 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 446 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  34.39 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  32.56 
 
 		 488 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  32.33 
 
 		 475 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  27.27 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  33.11 
 
 		 476 aa  176  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  33.48 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  31.05 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  29.98 
 
 		 488 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  33.85 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  27.82 
 
 		 482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  33.62 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  26.12 
 
 		 441 aa  164  5.0000000000000005e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  35.15 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  33.18 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  34.13 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  31.68 
 
 		 447 aa  160  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  32.81 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  28.35 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  27.21 
 
 		 442 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  32.2 
 
 		 460 aa  150  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  30.27 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  27.84 
 
 		 472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  31.63 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  31.63 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  31.42 
 
 		 451 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  32.04 
 
 		 475 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  31.49 
 
 		 452 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  30.46 
 
 		 477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  31.07 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  32 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  28.31 
 
 		 476 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  26.39 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  25.64 
 
 		 520 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  27.42 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  30.22 
 
 		 444 aa  99  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  29.4 
 
 		 479 aa  98.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  25.96 
 
 		 589 aa  87  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  26.75 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  21.65 
 
 		 553 aa  82.4  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  29.94 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  26.62 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36040  protoporphyrinogen oxidase  30.07 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0717647  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  27.41 
 
 		 487 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>