More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2008 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  88.46 
 
 		 182 aa  331  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  59.64 
 
 		 196 aa  204  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  55.83 
 
 		 182 aa  188  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  55.21 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  53.99 
 
 		 202 aa  177  7e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  52.87 
 
 		 191 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  48.17 
 
 		 228 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  50.3 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4209  putative acetyltransferase  51.83 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  57.14 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  53.33 
 
 		 192 aa  160  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  42.61 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2425  putative acetyltransferase  49.09 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0318047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  49.2 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  50.3 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  50 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  50.6 
 
 		 517 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.9 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  50 
 
 		 517 aa  154  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  49.69 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  50.91 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  48.19 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  47.46 
 
 		 194 aa  150  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  44.51 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  47.27 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  46.67 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.86 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.9 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.78 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  47.65 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  42.86 
 
 		 194 aa  148  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  49.39 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.4 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08610  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  47.8 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  44.91 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  47.62 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.31 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  43.53 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08990  hypothetical protein  44.12 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.05 
 
 		 193 aa  141  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  46.67 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  41.85 
 
 		 310 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  45.73 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.09 
 
 		 316 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  44.25 
 
 		 190 aa  137  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  42.39 
 
 		 317 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  44.85 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  46.63 
 
 		 304 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  43.45 
 
 		 315 aa  135  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.64 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  43.9 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.72 
 
 		 168 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  40.57 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  41.72 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  45.34 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  51.37 
 
 		 313 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.37 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  41.36 
 
 		 207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  45.68 
 
 		 312 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  41.92 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  42.05 
 
 		 309 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  43.4 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6855  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.67 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0929755 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.85 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1509  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.79 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  51.18 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  43.06 
 
 		 159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  43.54 
 
 		 160 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  43.4 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  39.1 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  41.1 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3687  hexapaptide repeat-containing transferase  53.08 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.222409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  45.03 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  39.86 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  44.8 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  46.94 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  41.13 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5491  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.36 
 
 		 219 aa  98.2  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.25 
 
 		 192 aa  97.8  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3011  hexapaptide repeat-containing transferase  39.44 
 
 		 192 aa  94.4  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.43 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  44.27 
 
 		 254 aa  94  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0245  acetyltransferase  37.75 
 
 		 158 aa  92  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  42.55 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  38.71 
 
 		 230 aa  90.5  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1700  hexapaptide repeat-containing transferase  37.91 
 
 		 246 aa  88.6  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0813  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.73 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  43.51 
 
 		 254 aa  86.3  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  37.76 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1240  hexapaptide repeat-containing transferase  35.84 
 
 		 246 aa  85.5  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0803  acetyl/acyl transferase related protein  44.9 
 
 		 212 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3255  acetyltransferase  38.89 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  36.36 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  41.98 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  34.78 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  39.31 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.79 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  38.22 
 
 		 252 aa  81.3  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1527  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.44 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.584038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>