More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2002 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  173  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  92.94 
 
 		 85 aa  162  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  77.65 
 
 		 88 aa  133  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000924332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  75.86 
 
 		 91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 86 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 92 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 88 aa  116  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  60 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 87 aa  110  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1509  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00258122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 93 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 88 aa  106  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 92 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 92 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  68.57 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 86 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 82 aa  102  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>