More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1990 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  86.12 
 
 
395 aa  692  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
390 aa  792  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  94.86 
 
 
390 aa  760  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  54.83 
 
 
387 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.78 
 
 
395 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.35 
 
 
400 aa  357  2e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.26 
 
 
400 aa  354  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.35 
 
 
398 aa  352  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  49.22 
 
 
400 aa  351  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.26 
 
 
400 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  47.26 
 
 
400 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  47.26 
 
 
400 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  47 
 
 
400 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  47 
 
 
400 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  48.31 
 
 
400 aa  349  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.81233e-05 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  47.11 
 
 
392 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.49 
 
 
385 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.79 
 
 
386 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.01 
 
 
399 aa  337  2e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.32 
 
 
387 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  45 
 
 
385 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
386 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.74 
 
 
384 aa  332  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  45.05 
 
 
386 aa  328  1e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.13 
 
 
386 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  45.93 
 
 
388 aa  326  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.6 
 
 
386 aa  326  4e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.33 
 
 
385 aa  325  7e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.22 
 
 
384 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.99 
 
 
390 aa  317  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  43.12 
 
 
385 aa  316  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  42.86 
 
 
385 aa  315  1e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 
388 aa  313  4e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.52 
 
 
387 aa  307  2e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 
387 aa  307  2e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.68 
 
 
388 aa  307  2e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.6 
 
 
387 aa  307  2e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.27 
 
 
387 aa  304  1e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 
382 aa  302  5e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.87 
 
 
384 aa  301  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 
382 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  41.88 
 
 
382 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 
382 aa  296  5e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.62 
 
 
382 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 
387 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 
387 aa  294  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  42.15 
 
 
389 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
382 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
382 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 
387 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  3.69007e-07 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
382 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 
388 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 
383 aa  289  5e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.9 
 
 
387 aa  289  5e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 
387 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  39.15 
 
 
381 aa  288  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
387 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 
382 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 
382 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 
382 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 
382 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  41.21 
 
 
390 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
383 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 
382 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  41.1 
 
 
382 aa  285  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  40.68 
 
 
382 aa  284  2e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  40.94 
 
 
390 aa  284  2e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 
382 aa  283  3e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 
382 aa  283  3e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
383 aa  283  4e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.68 
 
 
402 aa  283  5e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 
382 aa  282  6e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  40.68 
 
 
390 aa  282  7e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  40.05 
 
 
382 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
393 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  3.70848e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 
382 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
389 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 
382 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.85 
 
 
387 aa  280  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  38.08 
 
 
390 aa  280  4e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 
382 aa  279  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 
388 aa  279  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  42.08 
 
 
383 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
383 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 
387 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.72566e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.11 
 
 
383 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
382 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.53 
 
 
393 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  40.43 
 
 
382 aa  274  1e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.38 
 
 
383 aa  275  1e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 
383 aa  274  2e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.73 
 
 
381 aa  274  2e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.86 
 
 
382 aa  274  2e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 
383 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 
382 aa  273  4e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 
382 aa  273  5e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
383 aa  273  5e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
383 aa  273  5e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
383 aa  273  5e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  38.38 
 
 
383 aa  273  5e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>