225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1963 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  100 
 
 		 446 aa  886    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  78.47 
 
 		 418 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  50.82 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  34.18 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  33.87 
 
 		 479 aa  163  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  35.24 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  32.72 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  33.87 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  33.18 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  32.26 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  26.54 
 
 		 495 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  25.86 
 
 		 495 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  32.79 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  32.05 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  25.87 
 
 		 436 aa  119  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  26.28 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  28.33 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  32.35 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  28.19 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  30.27 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  24.53 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  24.53 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  28.64 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  28.89 
 
 		 422 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  24.84 
 
 		 478 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  26.61 
 
 		 484 aa  94.4  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  27.78 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  29.28 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  31.28 
 
 		 436 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  26.34 
 
 		 481 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  24.79 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  28.54 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  28.15 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  27.18 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  28.52 
 
 		 1199 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  26.98 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  28.03 
 
 		 409 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  25.06 
 
 		 422 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  24.58 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  32.22 
 
 		 426 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  24.58 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  24.73 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  24.58 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  32.27 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  25.64 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  24.74 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  27.98 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.12 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  29.05 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  29.19 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  28.79 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  28.57 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  30.21 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  27.01 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  31.59 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  29.95 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  30.12 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  27.93 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  29.72 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  28.11 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  28.85 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  27.47 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  28.53 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  26.56 
 
 		 624 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  25.56 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.93 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  25.71 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  28.31 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  27.9 
 
 		 474 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  29.08 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  28.94 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  26.12 
 
 		 625 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.87 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  30.2 
 
 		 487 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  30.2 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  30.2 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  27.13 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  30.2 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  24.92 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  29.23 
 
 		 628 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  26.98 
 
 		 459 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  29.7 
 
 		 487 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  23.73 
 
 		 592 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  32.31 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  26.15 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  26.05 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  29.21 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  23.47 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  29.21 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27.54 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  26.62 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  29.21 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  28.71 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  30.5 
 
 		 999 aa  63.9  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  25.42 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  26.43 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  27.23 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  28.39 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  25.21 
 
 		 1274 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  24.54 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>