142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1939 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
375 aa  775    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  56.68 
 
 
372 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  58.03 
 
 
353 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.82 
 
 
372 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  52.71 
 
 
368 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.69 
 
 
371 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  56.15 
 
 
257 aa  293  3e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  32.87 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  32.4 
 
 
259 aa  142  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  30.31 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  34.98 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  29.76 
 
 
281 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1590  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.76 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278078  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0829  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.65 
 
 
246 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  27.38 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  26.07 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.29 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.37 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.37 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.97 
 
 
309 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0815  hypothetical protein  31.25 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  hitchhiker  0.00116445 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  32.65 
 
 
421 aa  56.2  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  37.5 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.47 
 
 
267 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.55 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.77 
 
 
441 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  38.36 
 
 
393 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.94 
 
 
256 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.87 
 
 
293 aa  53.9  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  26.06 
 
 
481 aa  53.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  31.08 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.33 
 
 
334 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  30.3 
 
 
329 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.49 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.23 
 
 
306 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4410  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  54.55 
 
 
374 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
292 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  36.11 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  29.91 
 
 
292 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2126  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.67 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
293 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  39.62 
 
 
463 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.43 
 
 
370 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  36.62 
 
 
483 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  27.33 
 
 
351 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.31 
 
 
383 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.99 
 
 
315 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  26.53 
 
 
413 aa  49.7  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.36 
 
 
386 aa  49.7  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.56 
 
 
350 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  38.46 
 
 
416 aa  49.7  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3340  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.93 
 
 
347 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
597 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.47 
 
 
276 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  24.83 
 
 
251 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.03 
 
 
460 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.95 
 
 
255 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  29.65 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  40.68 
 
 
535 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 
225 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  53.49 
 
 
488 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.51 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  25.97 
 
 
459 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0088  putative DNA methylase protein  26.04 
 
 
217 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.346919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.37 
 
 
274 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.75 
 
 
302 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  53.66 
 
 
483 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  43.08 
 
 
512 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.71 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.98 
 
 
524 aa  47.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3803  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.71 
 
 
566 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  26.16 
 
 
350 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.43 
 
 
330 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  30.77 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  51.22 
 
 
435 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2607  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.1 
 
 
237 aa  46.6  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000328335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48 
 
 
368 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.33 
 
 
849 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  27.65 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.29 
 
 
947 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 
327 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  30.49 
 
 
312 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.22 
 
 
225 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.95 
 
 
271 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  36.92 
 
 
438 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0936  adenine specific DNA methylase MOD  46.15 
 
 
577 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000403504  normal  0.65434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0676  DNA methylase N-4/N-6  37.7 
 
 
520 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.635951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  28.21 
 
 
233 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  48.08 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.45 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.06 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  24.18 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.29 
 
 
528 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1282  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.23 
 
 
271 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0717608  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.94 
 
 
225 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  37.5 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.82 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.89 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>