More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1894 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  90.97 
 
 		 454 aa  828    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  100 
 
 		 454 aa  888    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1861  inner-membrane translocator  64.29 
 
 		 449 aa  508  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  52.28 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2652  inner-membrane translocator  52.79 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000103128  hitchhiker  0.00512558 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1207  inner-membrane translocator  46.39 
 
 		 541 aa  304  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0120652  normal  0.236247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  44.13 
 
 		 358 aa  273  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  44.13 
 
 		 358 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  44.07 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  47.18 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.49 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  46.9 
 
 		 363 aa  263  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  46.08 
 
 		 358 aa  263  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  43.08 
 
 		 378 aa  262  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.85 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.85 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.85 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.85 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.85 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.85 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  47.23 
 
 		 384 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.56 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 389 aa  259  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 398 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  44.69 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  44.76 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  42.74 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  43.6 
 
 		 375 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  43.6 
 
 		 375 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  44.07 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.54 
 
 		 389 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 389 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.71 
 
 		 389 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2727  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 385 aa  253  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3171  inner-membrane translocator  44.06 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  44.81 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  42.98 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3795  inner-membrane translocator  45.8 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  41.97 
 
 		 373 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  44.04 
 
 		 368 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6113  inner-membrane translocator  43.65 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 407 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 415 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3207  inner-membrane translocator  43.95 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  42.32 
 
 		 372 aa  237  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  41.74 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  43.27 
 
 		 376 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2030  inner-membrane translocator  46.2 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.710077  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.64 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  41.03 
 
 		 439 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5537  inner-membrane translocator  44.82 
 
 		 385 aa  226  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0760  inner-membrane translocator  43.85 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000323795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3004  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 583 aa  223  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2550  inner-membrane translocator  44.25 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 477 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  41.89 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.95 
 
 		 418 aa  219  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  40.73 
 
 		 408 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.1 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.06 
 
 		 423 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.89 
 
 		 412 aa  217  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.06 
 
 		 427 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.06 
 
 		 427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  41.19 
 
 		 660 aa  216  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.46 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.39 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  40.44 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  40.32 
 
 		 418 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.67 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.67 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  40.62 
 
 		 452 aa  210  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  38.55 
 
 		 463 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.67 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5270  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.67 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.78 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3350  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.67 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2857  inner-membrane translocator  43.83 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5017  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.67 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.38 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.38 
 
 		 423 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 463 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  40.45 
 
 		 417 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  42.94 
 
 		 456 aa  206  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 460 aa  206  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3572  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0134037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3064  inner-membrane translocator  39.34 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3033  inner-membrane translocator  39.34 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235152  normal  0.243359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3018  inner-membrane translocator  39.34 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2843  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50540  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  40.45 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0377625 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 		 459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>