57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1868 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  141  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  87.5 
 
 		 73 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  61.11 
 
 		 72 aa  94.4  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  54.17 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1611  hypothetical protein  41.79 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.931765  normal  0.039874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2964  hypothetical protein  41.79 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224822  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  37.88 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  40.68 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  42.25 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0914  hypothetical protein  43.59 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  45.71 
 
 		 70 aa  50.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  45.71 
 
 		 70 aa  50.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  43.75 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  42.25 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1090  hypothetical protein  36.07 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  43.55 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1689  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0427  hypothetical protein  41.18 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  43.28 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  52.46 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2797  hypothetical protein  38.81 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  41.54 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  38.71 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  46.03 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  42.42 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  37.29 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2241  hypothetical protein  48.33 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.778547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  43.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  43.33 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2099  hypothetical protein  37.31 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  36.23 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  32.39 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  44.26 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  34.38 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1034  hypothetical protein  35.48 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  45.9 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  40.91 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  38.1 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  35.21 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  35.94 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0794  hypothetical protein  40.98 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1062  hypothetical protein  35.48 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000331337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  46.03 
 
 		 62 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  35.38 
 
 		 65 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  40.3 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3650  hypothetical protein  39.68 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0755582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  42.86 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2628  hypothetical protein  34.78 
 
 		 72 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>