149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1857 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  65.97 
 
 
203 aa  255  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  55.1 
 
 
206 aa  208  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  53.48 
 
 
227 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  46.56 
 
 
218 aa  166  3e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  47.45 
 
 
203 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  45.74 
 
 
203 aa  162  4e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  45.41 
 
 
203 aa  158  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  45.83 
 
 
203 aa  157  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  45.45 
 
 
207 aa  141  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  41.62 
 
 
207 aa  139  2e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  43.07 
 
 
201 aa  114  1e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  43.57 
 
 
201 aa  113  2e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  35.46 
 
 
187 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.32173e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  42.54 
 
 
197 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  36.17 
 
 
187 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  37.28 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.87112e-10  decreased coverage  6.9205e-08 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  41.79 
 
 
197 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  36.94 
 
 
182 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  34.05 
 
 
188 aa  95.5  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  39.55 
 
 
197 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  37.04 
 
 
184 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  33.68 
 
 
189 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  38.98 
 
 
180 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  40.3 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  35.51 
 
 
257 aa  85.5  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  38.52 
 
 
253 aa  84  2e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.09479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  36.73 
 
 
193 aa  81.3  1e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.63106e-07  unclonable  1.37407e-10 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  33.58 
 
 
203 aa  77.8  1e-13  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  38.1 
 
 
182 aa  76.6  2e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  1.14136e-06 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  31.15 
 
 
187 aa  76.6  2e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  40.8 
 
 
191 aa  75.9  4e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  37.69 
 
 
191 aa  75.1  6e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  34.09 
 
 
190 aa  75.1  6e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  32.61 
 
 
190 aa  75.1  7e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  37.04 
 
 
192 aa  74.7  9e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  34.27 
 
 
193 aa  73.9  1e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  39.1 
 
 
198 aa  73.2  2e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  30.06 
 
 
185 aa  73.2  2e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  38.64 
 
 
197 aa  73.2  2e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  35.45 
 
 
189 aa  73.2  3e-12  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  5.57218e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  37.8 
 
 
186 aa  72.8  3e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  39.2 
 
 
191 aa  72.8  4e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  32.72 
 
 
192 aa  71.6  8e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  36.17 
 
 
189 aa  70.5  1e-11  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  34.11 
 
 
191 aa  70.9  1e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  33.55 
 
 
251 aa  71.2  1e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  37.69 
 
 
184 aa  70.5  2e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  31.94 
 
 
200 aa  69.3  3e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  33.54 
 
 
205 aa  69.3  3e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  33.11 
 
 
193 aa  69.3  4e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  31.87 
 
 
204 aa  68.2  8e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  28.42 
 
 
186 aa  67.8  1e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  30.91 
 
 
244 aa  67.4  1e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  28.22 
 
 
192 aa  67.8  1e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  35.56 
 
 
202 aa  67  2e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  7.573e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  32.97 
 
 
209 aa  67  2e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  32.53 
 
 
187 aa  67  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  30.41 
 
 
191 aa  65.9  4e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  31.62 
 
 
242 aa  65.9  4e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.23866e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  38.81 
 
 
200 aa  65.9  4e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  37.59 
 
 
199 aa  65.9  4e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.36885e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  32.56 
 
 
203 aa  65.1  6e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  31.25 
 
 
241 aa  63.9  1e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.58134e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  36.3 
 
 
207 aa  63.9  2e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  37.98 
 
 
195 aa  63.5  2e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  30.81 
 
 
187 aa  63.5  2e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  33.08 
 
 
207 aa  63.2  3e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  29.07 
 
 
204 aa  62.8  3e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  32.39 
 
 
190 aa  62.4  4e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  28.67 
 
 
181 aa  62.4  5e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  31.11 
 
 
188 aa  62  6e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  31.11 
 
 
188 aa  61.6  7e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  34.78 
 
 
205 aa  61.6  7e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  30.15 
 
 
245 aa  61.2  1e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  32.31 
 
 
184 aa  60.8  1e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  26.29 
 
 
191 aa  61.2  1e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  30.91 
 
 
190 aa  60.5  2e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  35 
 
 
218 aa  60.5  2e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  31.08 
 
 
205 aa  60.1  2e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  32.47 
 
 
186 aa  59.3  4e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3390  response regulator receiver protein  30.17 
 
 
197 aa  58.5  7e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  25.71 
 
 
191 aa  58.2  9e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
195 aa  57.4  1e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  33.81 
 
 
205 aa  57.8  1e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  31.13 
 
 
205 aa  56.6  3e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0580  protein of unknown function DUF820  32.28 
 
 
237 aa  56.2  3e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  30.34 
 
 
257 aa  55.5  5e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.45405e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  29.77 
 
 
195 aa  55.5  6e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  32.17 
 
 
193 aa  54.7  9e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  30.52 
 
 
187 aa  53.5  2e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  8.93331e-07 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5110  protein of unknown function DUF820  27.97 
 
 
145 aa  53.5  2e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10814  normal  0.277047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  29.5 
 
 
254 aa  53.9  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  34.53 
 
 
189 aa  53.9  2e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  29.05 
 
 
233 aa  53.1  3e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.29313e-06  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  24.58 
 
 
193 aa  53.1  3e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  28.06 
 
 
215 aa  52.4  4e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0693  protein of unknown function DUF820  29.5 
 
 
254 aa  52.4  4e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  31.3 
 
 
219 aa  52.8  4e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  32.58 
 
 
194 aa  52.4  5e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>