More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1836 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  100 
 
 
412 aa  796  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  79.8 
 
 
407 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  45.68 
 
 
392 aa  297  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  47.66 
 
 
395 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  35.19 
 
 
420 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  35.42 
 
 
418 aa  199  1e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  35.88 
 
 
425 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  33.33 
 
 
420 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  33.08 
 
 
420 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  34.99 
 
 
427 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  35.79 
 
 
405 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  35.68 
 
 
430 aa  180  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  35.68 
 
 
412 aa  181  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  35.68 
 
 
412 aa  181  3e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  35.68 
 
 
430 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  35.68 
 
 
412 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  35.68 
 
 
412 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  35.68 
 
 
412 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  34 
 
 
413 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  34.98 
 
 
405 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  4.64132e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  35.78 
 
 
412 aa  176  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  4.99606e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
413 aa  175  2e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
415 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  34.16 
 
 
405 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
425 aa  169  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  34.16 
 
 
405 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  34.16 
 
 
405 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  32.9 
 
 
417 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  31.85 
 
 
431 aa  167  3e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  31.87 
 
 
418 aa  167  3e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  33.91 
 
 
410 aa  166  6e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
431 aa  166  6e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 
415 aa  165  1e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  34.34 
 
 
407 aa  164  2e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  33.01 
 
 
412 aa  164  2e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
412 aa  163  4e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
414 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  34.32 
 
 
410 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  32.26 
 
 
493 aa  160  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  33.17 
 
 
410 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  32.76 
 
 
414 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  34.05 
 
 
423 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  30.52 
 
 
415 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
411 aa  153  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  30.83 
 
 
418 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  35.25 
 
 
461 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  29.18 
 
 
445 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  29.41 
 
 
434 aa  146  6e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  28.84 
 
 
434 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  28.36 
 
 
432 aa  142  1e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  31.16 
 
 
416 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  31.23 
 
 
389 aa  139  9e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
413 aa  135  2e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  32.9 
 
 
397 aa  131  2e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  32.35 
 
 
417 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  32.47 
 
 
390 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
421 aa  129  1e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
446 aa  129  1e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.64401e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  30.67 
 
 
417 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  30.73 
 
 
390 aa  126  8e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  32.47 
 
 
390 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
437 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  31.06 
 
 
420 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
420 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  28.29 
 
 
443 aa  124  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  31.01 
 
 
428 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  29.1 
 
 
443 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
395 aa  118  2e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  27.2 
 
 
432 aa  118  2e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  27.2 
 
 
432 aa  118  2e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  29.74 
 
 
434 aa  117  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  31.72 
 
 
450 aa  112  1e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.22 
 
 
430 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  26.22 
 
 
430 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  28.57 
 
 
432 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
441 aa  109  9e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  28.03 
 
 
427 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  31.58 
 
 
407 aa  103  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  30.5 
 
 
433 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
407 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  28.94 
 
 
423 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  27.39 
 
 
431 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  28.05 
 
 
434 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  29.15 
 
 
423 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  28.29 
 
 
431 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  26.75 
 
 
428 aa  97.4  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  28.09 
 
 
437 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  28.09 
 
 
437 aa  96.3  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.73012e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
371 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  28.77 
 
 
416 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  26.04 
 
 
432 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
436 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  26.63 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.53779e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  24.83 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  26.63 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  27.53 
 
 
443 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  23.8 
 
 
410 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  27.76 
 
 
451 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>