74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1782 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 76 aa  151  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  94.74 
 
 		 76 aa  145  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  61.84 
 
 		 77 aa  103  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 		 84 aa  73.6  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1584  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00433651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 77 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 77 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  45.95 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  45.95 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.5 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  50.75 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  34.72 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.33 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  31.51 
 
 		 153 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 94 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  26.67 
 
 		 76 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 		 93 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 79 aa  40  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>