More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1764 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  71.48 
 
 
265 aa  355  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 
265 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 
248 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  37.13 
 
 
264 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.92 
 
 
246 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3111  putative hydrolase  35.02 
 
 
258 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1557  hypothetical protein  35.17 
 
 
241 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 
392 aa  99.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2020  alpha/beta hydrolase fold protein  31.22 
 
 
216 aa  95.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 
396 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 
263 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.38 
 
 
301 aa  92.8  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.9 
 
 
263 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  28.1 
 
 
283 aa  92.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  32.78 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2775  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 
621 aa  88.6  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1525  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.43 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
266 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
264 aa  85.5  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0770  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.08 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0656  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.58 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.24 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  29.96 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.62 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  32.11 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  25.97 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.85 
 
 
266 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  27.52 
 
 
263 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  28.97 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  27.34 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
353 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  28.98 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  22.49 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.98 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.98 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  23.74 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.98 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.12 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.87 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  27.48 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  30.12 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
278 aa  72  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.03 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.95 
 
 
256 aa  72  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  22.63 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  41 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  27.56 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  27.96 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  25.48 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  29.43 
 
 
456 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1960  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000316355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3368  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000257055  hitchhiker  3.4538199999999996e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1822  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.89 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.12 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>