42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1748 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  90.05 
 
 		 432 aa  808    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  100 
 
 		 432 aa  883    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  50 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  51.61 
 
 		 456 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  50.69 
 
 		 459 aa  458  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  49.33 
 
 		 453 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  49.03 
 
 		 468 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  43.23 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  47.02 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  46.51 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  48.2 
 
 		 538 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  47.04 
 
 		 538 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  46.57 
 
 		 538 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  43.4 
 
 		 478 aa  364  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  41.91 
 
 		 519 aa  341  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  41.3 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  43.57 
 
 		 578 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  38.22 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  39.63 
 
 		 434 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  37.09 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  37.88 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  36.92 
 
 		 435 aa  286  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  37.3 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  37.3 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  37.65 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  38.46 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  38.5 
 
 		 472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  36.15 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  38.22 
 
 		 466 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  35.47 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  36.9 
 
 		 499 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  37.05 
 
 		 460 aa  269  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  35.84 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  35.84 
 
 		 460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  35.84 
 
 		 460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  36.62 
 
 		 466 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  37.14 
 
 		 470 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  36.47 
 
 		 466 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  36.47 
 
 		 466 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  34.51 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  37.19 
 
 		 427 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  34.19 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>