52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1746 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  100 
 
 
238 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  75.47 
 
 
216 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  48.15 
 
 
197 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  41.92 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  43.65 
 
 
268 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  41.48 
 
 
248 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  43.02 
 
 
257 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  39.36 
 
 
233 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  35.71 
 
 
871 aa  141  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  35.2 
 
 
280 aa  140  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  33.84 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  32.56 
 
 
509 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  36.79 
 
 
240 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  32.28 
 
 
231 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  30.73 
 
 
230 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  31.63 
 
 
243 aa  112  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  44.44 
 
 
167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  34.18 
 
 
232 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  30.32 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  25.79 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  24.5 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  29.44 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  27.46 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.44 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  27.04 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  28.5 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  32.74 
 
 
383 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  23.74 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  26.04 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  29.61 
 
 
275 aa  55.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  23.59 
 
 
228 aa  55.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1343  lysophospholipase L1 or related esterase  27.27 
 
 
171 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000279155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26 
 
 
183 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2205  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  22.17 
 
 
257 aa  52.4  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04656  hypothetical protein  51.22 
 
 
48 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15268  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  26.74 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  29.84 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  24.24 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  23.94 
 
 
152 aa  48.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  24.23 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0641  hypothetical protein  26.59 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.726256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  24.59 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22.01 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0744  lysophospholipase L1 related esterase  21.71 
 
 
180 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  27.44 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  28.5 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  27.44 
 
 
286 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  20.3 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  31.09 
 
 
372 aa  42.4  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  30.72 
 
 
244 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>